RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620944.4

NME4-211, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NME4, Length 1,193 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-211ENST00000620944 YARSP54577 528 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 ITIH3Q06033 890 aa23.87■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 RESTQ13127 1097 aa23.87■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 KARSQ15046 597 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 GPBP1Q86WP2 473 aa23.87■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 SPIRE2Q8WWL2 714 aa23.87■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa23.87■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 S1PR5Q9H228 398 aa23.87■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 ADAM28Q9UKQ2 775 aa23.87■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa23.86■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 CASTOR2A6NHX0 329 aa23.86■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 F8W810 466 aa23.86■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 H0YCG3 227 aa23.86■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 DCXO43602 365 aa23.86■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 STX6O43752 255 aa23.86■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 EPCAMP16422 314 aa23.86■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 PLCG1P19174 1290 aa23.86■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 GRIN1Q05586 938 aa23.86■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 ZBTB33Q86T24 672 aa23.86■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 SUSD6Q92537 303 aa23.86■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 RABGGTAQ92696 567 aa23.86■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 KLHL5Q96PQ7 755 aa23.86■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 PTGESO14684 152 aa23.85■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 ADH1AP07327 375 aa23.85■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 CNPP09543 421 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 TXLNAP40222 546 aa23.85■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 USP41Q3LFD5 358 aa23.85■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 TMEM31Q5JXX7 168 aa23.85■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 FUT10Q6P4F1 479 aa23.85■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 FAM173BQ6P4H8 233 aa23.85■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa23.85■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 TAS1R1Q7RTX1 841 aa23.85■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 RIPOR3Q96MK2 946 aa23.85■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 CDT1Q9H211 546 aa23.85■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 ADAM7Q9H2U9 754 aa23.85■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 ODF2LQ9ULJ1 636 aa23.85■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 MTMR6Q9Y217 621 aa23.85■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP23.84■■□□□ 1.415e-9■■■■■ 129.7
NME4-211ENST00000620944 FAM13AO94988 1023 aa23.84■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 HARSP12081 509 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 OSTNP61366 133 aa23.84■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 MPZL3Q6UWV2 235 aa23.84■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 TAS1R3Q7RTX0 852 aa23.84■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa23.84■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 SLC22A17Q8WUG5 538 aa23.84■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 RAD54LQ92698 747 aa23.84■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 SNX21Q969T3 373 aa23.84■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 BICD1Q96G01 975 aa23.84■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 FBXL18Q96ME1 805 aa23.84■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 NECTIN4Q96NY8 510 aa23.84■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 REEP2Q9BRK0 252 aa23.84■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 ZHX3Q9H4I2 956 aa23.84■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa23.84■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 CACNG4Q9UBN1 327 aa23.84■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 CCDC39Q9UFE4 941 aa23.84■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 TBCAO75347 108 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 MCF2P10911 925 aa23.83■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 GRM5P41594 1212 aa23.83■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP23.83■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 DSG1Q02413 1049 aa23.83■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 MCM6Q14566 821 aa23.83■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 PTPAQ15257 358 aa23.83■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 ARSHQ5FYA8 562 aa23.83■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 GLRA4Q5JXX5 417 aa23.83■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 RNF135Q8IUD6 432 aa23.83■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 MYCT1Q8N699 235 aa23.83■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 HASPINQ8TF76 798 aa23.83■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 GPR62Q9BZJ7 368 aa23.83■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa23.83■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 DPP7Q9UHL4 492 aa23.83■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
NME4-211ENST00000620944 FAM86C2PA6NEL3 165 aa23.82■■□□□ 1.4
NME4-211ENST00000620944 LOC730098B7Z3J9 87 aa23.82■■□□□ 1.4
NME4-211ENST00000620944 LILRB3O75022 631 aa23.82■■□□□ 1.4
NME4-211ENST00000620944 MAPTP10636 758 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
NME4-211ENST00000620944 MTHFRP42898 656 aa23.82■■□□□ 1.4
NME4-211ENST00000620944 CLCN4P51793 760 aa23.82■■□□□ 1.4
NME4-211ENST00000620944 CREMQ03060 361 aa23.82■■□□□ 1.4
NME4-211ENST00000620944 SPECC1Q5M775 1068 aa23.82■■□□□ 1.4
NME4-211ENST00000620944 KIAA0319Q5VV43 1072 aa23.82■■□□□ 1.4
NME4-211ENST00000620944 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
NME4-211ENST00000620944 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
NME4-211ENST00000620944 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
NME4-211ENST00000620944 B3GALT6Q96L58 329 aa23.82■■□□□ 1.4
NME4-211ENST00000620944 PAAF1Q9BRP4 392 aa23.82■■□□□ 1.4
NME4-211ENST00000620944 CCSER1Q9C0I3 900 aa23.82■■□□□ 1.4
NME4-211ENST00000620944 SFXN1Q9H9B4 322 aa23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms