RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 C4AP0C0L4 1744 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 MPIG6BO95866 241 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 ASGR2P07307 311 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 LPOP22079 712 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 EPHX2P34913 555 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 MANFP55145 182 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 NFIXQ14938 502 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 CCDC93Q567U6 631 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 ETV3LQ6ZN32 361 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 SMIM5Q71RC9 77 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 TMC6Q7Z403 805 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 GPC2Q8N158 579 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 MASTLQ96GX5 879 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 WNT8AQ9H1J5 351 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 LTN1O94822 1766 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 KIF13BQ9NQT8 1826 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 DDNO94850 711 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 OSMP13725 252 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 AGXTP21549 392 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 AKAP5P24588 427 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 ALDH1B1P30837 517 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 STAT5AP42229 794 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 SLC5A3P53794 718 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 SLC6A3Q01959 620 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 ROM1Q03395 351 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 SYCP2LQ5T4T6 812 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 FAM26EQ8N5C1 309 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 MAML3Q96JK9 1138 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 CAPNS2Q96L46 248 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 MYL10Q9BUA6 226 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 ANLNQ9NQW6 1124 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 NCAPD2Q15021 1401 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 UBR3Q6ZT12 1888 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF839A8K0R7 811 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 NFIBO00712 420 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 AP1G1O43747 822 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 OFD1O75665 1012 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 PRLP01236 227 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 MC4RP32245 332 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 MTNR1BP49286 362 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 PURAQ00577 322 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 NOGQ13253 232 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 OLFML2BQ68BL8 750 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 SLFN12LQ6IEE8 588 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 LIPIQ6XZB0 460 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 EXOC8Q8IYI6 725 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 CNBD1Q8NA66 436 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 AUTS2Q8WXX7 1259 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 FOXB1Q99853 325 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 AMNQ9BXJ7 453 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 RNF38Q9H0F5 515 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 VPS33BQ9H267 617 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 RBPJLQ9UBG7 517 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 COMMD10Q9Y6G5 202 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF831Q5JPB2 1677 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 CARMIL3Q8ND23 1372 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 PRSS38A1L453 326 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 PEX10O60683 326 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 LPLP06858 475 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 C8BP07358 591 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 NCAM1P13591 858 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 PTGS1P23219 599 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 ADKP55263 362 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 ADCY2Q08462 1091 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 MYBPC3Q14896 1274 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 PITRM1Q5JRX3 1037 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 KIAA1841Q6NSI8 718 aa6.71□□□□□ -1.34
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