RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555916.1

AC005480.1-202, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AC005480.1, Length 3,548 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC005480.1-202ENST00000555916 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 NSMFQ6X4W1 530 aa6.76□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 RIOX2Q8IUF8 465 aa6.76□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 IQCKQ8N0W5 287 aa6.76□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 TBCKQ8TEA7 893 aa6.76□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 SNX29Q8TEQ0 813 aa6.76□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 COA7Q96BR5 231 aa6.76□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 CEP63Q96MT8 703 aa6.76□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 SPAG5Q96R06 1193 aa6.76□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 NUDT12Q9BQG2 462 aa6.76□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 SPATC1LQ9H0A9 340 aa6.76□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa6.76□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP6.76□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 PRKAB1Q9Y478 270 aa6.76□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa6.76□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 CYTH3O43739 400 aa6.76□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 FSBPO95073 299 aa6.76□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 MAPK4P31152 587 aa6.76□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 VEGFBP49765 207 aa6.76□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 SNAP25P60880 206 aa6.76□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 TNNC1P63316 161 aa6.76□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 KCNB1Q14721 858 aa6.76□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 FAM110CQ1W6H9 321 aa6.76□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 ANKRD35Q8N283 1001 aa6.76□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 UBR7Q8N806 425 aa6.76□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 MGARPQ8TDB4 240 aa6.76□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 DEPDC7Q96QD5 511 aa6.76□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 ENAMQ9NRM1 1142 aa6.76□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 SCINQ9Y6U3 715 aa6.76□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 GMNCA6NCL1 334 aa6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 DNM1LO00429 736 aa6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 KRIT1O00522 736 aa6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 AOC2O75106 756 aa6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 CFBP00751 764 aa6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 CYP2C8P10632 490 aa6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 HOXD10P28358 340 aa6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 CNGA1P29973 690 aa6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 AP3B2Q13367 1082 aa6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 SNCBQ16143 134 aa6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 PDXDC1Q6P996 788 aa6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 KDM7AQ6ZMT4 941 aa6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 ANKS3Q6ZW76 656 aa6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 RDH13Q8NBN7 331 aa6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 PLPP7Q8NBV4 271 aa6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 ERGIC2Q96RQ1 377 aa6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 TSG101Q99816 390 aa6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 TRIM55Q9BYV6 548 aa6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 NEUROG2Q9H2A3 272 aa6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 MLXIPLQ9NP71 852 aa6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 CNTN3Q9P232 1028 aa6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 LZTS1Q9Y250 596 aa6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 SIK3Q9Y2K2 1263 aa6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 PFASO15067 1338 aa6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 STXBP3O00186 592 aa6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 TDP2O95551 362 aa6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 VIMP08670 466 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 ABCB4P21439 1286 aa6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 NEDD9Q14511 834 aa6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 LONRF1Q17RB8 773 aa6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 WLSQ5T9L3 541 aa6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 RNF207Q6ZRF8 634 aa6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 KCNK18Q7Z418 384 aa6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 DAAM2Q86T65 1068 aa6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 MMP19Q99542 508 aa6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 TRIM51Q9BSJ1 452 aa6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 RBCK1Q9BYM8 510 aa6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 RIC8AQ9NPQ8 531 aa6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 MORF4L1Q9UBU8 362 aa6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 CEP83Q9Y592 693 aa6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 MYH7BA7E2Y1 1941 aa6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 TTI1O43156 1089 aa6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 SART1O43290 800 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 TLR2O60603 784 aa6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 FAM107AO95990 144 aa6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 PAX7P23759 505 aa6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 ELF1P32519 619 aa6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 PEX19P40855 299 aa6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 SEC13P55735 322 aa6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 ADCY1Q08828 1119 aa6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 TMEM132BQ14DG7 1078 aa6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 TOMM20Q15388 145 aa6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 CYB5D1Q6P9G0 228 aa6.75□□□□□ -1.33
AC005480.1-202ENST00000555916 CAVIN3Q969G5 261 aa6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms