RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550724.2

HECTD4-212, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 3

Gene HECTD4, Length 587 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4-212ENST00000550724 STRN3Q13033 797 aa15.9■□□□□ 0.14
HECTD4-212ENST00000550724 RESTQ13127 1097 aa15.9■□□□□ 0.14
HECTD4-212ENST00000550724 MAPK7Q13164 816 aa15.9■□□□□ 0.14
HECTD4-212ENST00000550724 ZNF568Q3ZCX4 644 aa15.9■□□□□ 0.14
HECTD4-212ENST00000550724 TMEM31Q5JXX7 168 aa15.9■□□□□ 0.14
HECTD4-212ENST00000550724 SPECC1Q5M775 1068 aa15.9■□□□□ 0.14
HECTD4-212ENST00000550724 GPBP1Q86WP2 473 aa15.9■□□□□ 0.14
HECTD4-212ENST00000550724 HASPINQ8TF76 798 aa15.9■□□□□ 0.14
HECTD4-212ENST00000550724 TIPINQ9BVW5 301 aa15.9■□□□□ 0.14
HECTD4-212ENST00000550724 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
HECTD4-212ENST00000550724 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
HECTD4-212ENST00000550724 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
HECTD4-212ENST00000550724 ZHX3Q9H4I2 956 aa15.9■□□□□ 0.14
HECTD4-212ENST00000550724 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
HECTD4-212ENST00000550724 IRAK3Q9Y616 596 aa15.9■□□□□ 0.14
HECTD4-212ENST00000550724 DCXO43602 365 aa15.89■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 THP07101 528 aa15.89■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 PLS3P13797 630 aa15.89■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 PLCG1P19174 1290 aa15.89■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 COL9A1P20849 921 aa15.89■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 SMTNP53814 917 aa15.89■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 TUSC3Q13454 348 aa15.89■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 GLRA4Q5JXX5 417 aa15.89■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 PPFIBP1Q86W92 1011 aa15.89■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 RNF135Q8IUD6 432 aa15.89■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 SLC22A17Q8WUG5 538 aa15.89■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 PAAF1Q9BRP4 392 aa15.89■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 TMEM134Q9H6X4 195 aa15.89■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 DZANK1Q9NVP4 752 aa15.89■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa15.89■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 MUTYHQ9UIF7 546 aa15.89■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 ADAM28Q9UKQ2 775 aa15.89■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 TNFSF13BQ9Y275 285 aa15.89■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa15.89■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 PTGESO14684 152 aa15.88■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP15.88■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 YARSP54577 528 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 MCM6Q14566 821 aa15.88■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 FUT10Q6P4F1 479 aa15.88■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 TMC5Q6UXY8 1006 aa15.88■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 TAS1R3Q7RTX0 852 aa15.88■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 CEP57Q86XR8 500 aa15.88■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 GLYCTKQ8IVS8 523 aa15.88■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 KCTD17Q8N5Z5 321 aa15.88■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 CEP120Q8N960 986 aa15.88■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 SUSD6Q92537 303 aa15.88■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 FBXL18Q96ME1 805 aa15.88■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 GPR62Q9BZJ7 368 aa15.88■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 CDT1Q9H211 546 aa15.88■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 ADAM7Q9H2U9 754 aa15.88■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 C17orf75Q9HAS0 396 aa15.88■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa15.88■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa15.88■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 MTMR6Q9Y217 621 aa15.88■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 MUC3AQ02505 3323 aa15.87■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 SLC26A4O43511 780 aa15.87■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 LILRB3O75022 631 aa15.87■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 FAM13AO94988 1023 aa15.87■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 USP41Q3LFD5 358 aa15.87■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 ARSHQ5FYA8 562 aa15.87■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 HSCBQ8IWL3 235 aa15.87■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 MYCT1Q8N699 235 aa15.87■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 SPIRE2Q8WWL2 714 aa15.87■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 RAD54LQ92698 747 aa15.87■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 BICD1Q96G01 975 aa15.87■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 EPSTI1Q96J88 318 aa15.87■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 REEP2Q9BRK0 252 aa15.87■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 LRFN3Q9BTN0 628 aa15.87■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 KCND2Q9NZV8 630 aa15.87■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 NCOR1O75376 2440 aa15.87■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa15.87■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 LOC730098B7Z3J9 87 aa15.86■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 TEX28O15482 410 aa15.86■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 STX6O43752 255 aa15.86■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 KIF4AO95239 1232 aa15.86■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 ADH1AP07327 375 aa15.86■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 SPATA31D3P0C874 917 aa15.86■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 RPL17P18621 184 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 GRM5P41594 1212 aa15.86■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 CLCN4P51793 760 aa15.86■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 DSG1Q02413 1049 aa15.86■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 ITIH3Q06033 890 aa15.86■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 PTPAQ15257 358 aa15.86■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 ATAT1Q5SQI0 421 aa15.86■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 KIAA0319Q5VV43 1072 aa15.86■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 MPZL3Q6UWV2 235 aa15.86■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa15.86■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 USP49Q70CQ1 688 aa15.86■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 PALB2Q86YC2 1186 aa15.86■□□□□ 0.13
HECTD4-212ENST00000550724 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms