RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 SLC22A17Q8WUG5 538 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 RSPH1Q8WYR4 309 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 TMX3Q96JJ7 454 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 PDZD7Q9H5P4 517 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 MARCH5Q9NX47 278 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 POLIQ9UNA4 740 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 TECTAO75443 2155 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 STK25O00506 426 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 SLC16A4O15374 487 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 TEX28O15482 410 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 HIP1RO75146 1068 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 GLUD1P00367 558 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 KRT18P05783 430 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 THP07101 528 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 RFX1P22670 979 aa8.89□□□□□ -0.99
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CTPS1-209ENST00000480420 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 CLCN4P51793 760 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 YARSP54577 528 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 POU5F1BQ06416 359 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 KCNC3Q14003 757 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 PTPN21Q16825 1174 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 USP41Q3LFD5 358 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 ATF7IP2Q5U623 682 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 FUT10Q6P4F1 479 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 CCDC149Q6ZUS6 474 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 KIFAP3Q92845 792 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 PRIMPOLQ96LW4 560 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 PAAF1Q9BRP4 392 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 RUSC1Q9BVN2 902 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 NFKBIZQ9BYH8 718 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 GPR62Q9BZJ7 368 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 MFSD1Q9H3U5 465 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 SMOC2Q9H3U7 446 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 ZHX3Q9H4I2 956 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 SFXN1Q9H9B4 322 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 KMT5AQ9NQR1 393 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 STK39Q9UEW8 545 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 ADAM28Q9UKQ2 775 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 USP34Q70CQ2 3546 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 CITO14578 2027 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 CFAP54Q96N23 3096 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 I3L4J1 428 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 ACKR2O00590 384 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 INPPL1O15357 1258 aa8.88□□□□□ -0.99
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CTPS1-209ENST00000480420 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 EDN1P05305 212 aa8.88□□□□□ -0.99
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CTPS1-209ENST00000480420 EFNA5P52803 228 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 ARPP19P56211 112 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 DSC1Q08554 894 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 SIGLEC14Q08ET2 396 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 STRN3Q13033 797 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 TUSC3Q13454 348 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 MTMR3Q13615 1198 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 PDIA5Q14554 519 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 IL17AQ16552 155 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF568Q3ZCX4 644 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 RILPL1Q5EBL4 403 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 C4orf32Q8N8J7 132 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 BICD1Q96G01 975 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 DRC1Q96MC2 740 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 PHOX2BQ99453 314 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 CXCL16Q9H2A7 254 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 FZD8Q9H461 694 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 FBXL21Q9UKT6 434 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 IRAK3Q9Y616 596 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 STK24Q9Y6E0 443 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 CACNA1HO95180 2353 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 TRIOO75962 3097 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP8.87□□□□□ -0.999e-6■■■■■ 68.9
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CTPS1-209ENST00000480420 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa8.87□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 LAD1O00515 517 aa8.87□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 KIF4AO95239 1232 aa8.87□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 BRD1O95696 1058 aa8.87□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 NPTX2P47972 431 aa8.87□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 DSG1Q02413 1049 aa8.87□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 PSMD5Q16401 504 aa8.87□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa8.87□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 IER5LQ5T953 404 aa8.87□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 NT5DC1Q5TFE4 455 aa8.87□□□□□ -0.99
CTPS1-209ENST00000480420 LIN9Q5TKA1 542 aa8.87□□□□□ -0.99
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