RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368876.2

AMD1-201, Transcript of adenosylmethionine decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene AMD1, Length 3,040 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1-201ENST00000368876 TANGO2Q6ICL3 276 aa9.54□□□□□ -0.88
AMD1-201ENST00000368876 CATSPER4Q7RTX7 472 aa9.54□□□□□ -0.88
AMD1-201ENST00000368876 SMARCD2Q92925 531 aa9.54□□□□□ -0.88
AMD1-201ENST00000368876 EBF1Q9UH73 591 aa9.54□□□□□ -0.88
AMD1-201ENST00000368876 KLK13Q9UKR3 277 aa9.54□□□□□ -0.88
AMD1-201ENST00000368876 ARNTLO00327 626 aa9.53□□□□□ -0.88
AMD1-201ENST00000368876 DHX15O43143 795 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
AMD1-201ENST00000368876 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
AMD1-201ENST00000368876 WEE1P30291 646 aa9.53□□□□□ -0.88
AMD1-201ENST00000368876 GRIK3Q13003 919 aa9.53□□□□□ -0.88
AMD1-201ENST00000368876 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
AMD1-201ENST00000368876 ASB16Q96NS5 453 aa9.53□□□□□ -0.88
AMD1-201ENST00000368876 PPP1R16BQ96T49 567 aa9.53□□□□□ -0.88
AMD1-201ENST00000368876 TTPALQ9BTX7 342 aa9.53□□□□□ -0.88
AMD1-201ENST00000368876 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
AMD1-201ENST00000368876 WDR27A2RRH5 827 aa9.53□□□□□ -0.88
AMD1-201ENST00000368876 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
AMD1-201ENST00000368876 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
AMD1-201ENST00000368876 SFNP31947 248 aa9.53□□□□□ -0.88
AMD1-201ENST00000368876 HOXD12P35452 270 aa9.53□□□□□ -0.88
AMD1-201ENST00000368876 NTHL1P78549 312 aa9.53□□□□□ -0.88
AMD1-201ENST00000368876 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
AMD1-201ENST00000368876 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
AMD1-201ENST00000368876 BCL11AQ9H165 835 aa9.53□□□□□ -0.88
AMD1-201ENST00000368876 SLC8A2Q9UPR5 921 aa9.53□□□□□ -0.88
AMD1-201ENST00000368876 BACE2Q9Y5Z0 518 aa9.53□□□□□ -0.88
AMD1-201ENST00000368876 SPAG17Q6Q759 2223 aa9.53□□□□□ -0.88
AMD1-201ENST00000368876 CCL16O15467 120 aa9.53□□□□□ -0.88
AMD1-201ENST00000368876 SPINK2P20155 84 aa9.53□□□□□ -0.88
AMD1-201ENST00000368876 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
AMD1-201ENST00000368876 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
AMD1-201ENST00000368876 CCDC26Q8TAB7 109 aa9.53□□□□□ -0.88
AMD1-201ENST00000368876 FAM200AQ8TCP9 573 aa9.53□□□□□ -0.88
AMD1-201ENST00000368876 FAM227BQ96M60 508 aa9.53□□□□□ -0.88
AMD1-201ENST00000368876 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
AMD1-201ENST00000368876 WDR64B1ANS9 1081 aa9.52□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 RHOP08100 348 aa9.52□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 SPATA31D3P0C874 917 aa9.52□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 CALM1P0DP23 149 aa9.52□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 CALM2P0DP24 149 aa9.52□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 CALM3P0DP25 149 aa9.52□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 TRDNQ13061 729 aa9.52□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 CCINQ13939 588 aa9.52□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 PSMD5Q16401 504 aa9.52□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa9.52□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 RABEPKQ7Z6M1 372 aa9.52□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 CLSTN3Q9BQT9 956 aa9.52□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 RIC8AQ9NPQ8 531 aa9.52□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 LNP1A1A4G5 178 aa9.52□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 GDI1P31150 447 aa9.52□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 JAK3P52333 1124 aa9.52□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 SCAPQ12770 1279 aa9.52□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 UBXN11Q5T124 520 aa9.52□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 C19orf48Q6RUI8 117 aa9.52□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 VITQ6UXI7 678 aa9.52□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 HAUS6Q7Z4H7 955 aa9.52□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 TPCN1Q9ULQ1 816 aa9.52□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 A0A087WV48 116 aa9.51□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 CCER2I3L3R5 266 aa9.51□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 CCNE1P24864 410 aa9.51□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 FCHO2Q0JRZ9 810 aa9.51□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 SPDYCQ5MJ68 293 aa9.51□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa9.51□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 MCRS1Q96EZ8 462 aa9.51□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 MKNK1Q9BUB5 465 aa9.51□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 GABBR1Q9UBS5 961 aa9.51□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 J3QKU1 62 aa9.51□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 CAPN9O14815 690 aa9.51□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 ASAP2O43150 1006 aa9.51□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 EPHA5P54756 1037 aa9.51□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 SEMA3BQ13214 749 aa9.51□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 CCDC6Q16204 474 aa9.51□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa9.51□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 FAM78AQ5JUQ0 283 aa9.51□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 YAF2Q8IY57 180 aa9.51□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 LRRC71Q8N4P6 559 aa9.51□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 SLC7A14Q8TBB6 771 aa9.51□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 ANO3Q9BYT9 981 aa9.51□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 MTRRQ9UBK8 725 aa9.51□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa9.5□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa9.5□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 ZNF605Q86T29 641 aa9.5□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 PLA2G4DQ86XP0 818 aa9.5□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 DEFB124Q8NES8 71 aa9.5□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 GPR62Q9BZJ7 368 aa9.5□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa9.5□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 A0A087WZ62 844 aa9.5□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa9.5□□□□□ -0.89
AMD1-201ENST00000368876 ARL5CA6NH57 179 aa9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms