RNA–Protein interactions for RNA: YOL091W

SPO21, Transcript of Component of the meiotic outer plaque of the spindle pole body, yeast

Gene SPO21, Length 1,830 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPO21	YOL091W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	YKL063C	P35725	167 aa		0.57	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	0.57	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	RPC37	P36121	282 aa		0.57	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	COG3	P40094	801 aa		0.57	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	YGL185C	P53100	379 aa		0.57	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	SWC4	P53201	476 aa		0.57	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	SDC1	Q03323	175 aa		0.57	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	ECM18	Q04623	453 aa		0.57	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	ASR1	Q06834	288 aa		0.57	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	YPR064W	Q12492	139 aa		0.57	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	ATP6	P00854	259 aa		0.56	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	POX1	P13711	748 aa		0.56	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	GPI12	P23797	304 aa		0.56	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	CSG2	P35206	410 aa		0.56	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	BLI1	P35727	113 aa		0.56	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	YOR062C	P36025	268 aa		0.56	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	HMT1	P38074	348 aa		0.56	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	YDR089W	P38966	869 aa		0.56	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	GON7	P46984	123 aa		0.56	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	YJL016W	P47072	561 aa		0.56	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	0.56	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	OPI1	P21957	404 aa		0.55	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	PET18	P25362	215 aa		0.55	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	0.55	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	0.55	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	PHO89	P38361	574 aa		0.55	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	AGP3	P43548	558 aa		0.55	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	0.55	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	IBA57	P47158	497 aa		0.55	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	MDM34	P53083	459 aa		0.55	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	PEX31	P53203	462 aa		0.55	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	YML018C	Q03730	393 aa		0.55	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	ARV1	Q06541	321 aa		0.55	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	POM33	Q12164	279 aa		0.55	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	SIA1	Q12212	622 aa		0.55	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	YPL247C	Q12523	523 aa		0.55	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	IZH4	Q99393	312 aa		0.55	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	SPT7	P35177	1332 aa		0.55	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	PPH21	P23594	369 aa		0.54	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	YCR102C	P25608	368 aa		0.54	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	SUA5	P32579	426 aa		0.54	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	YHI9	P38765	294 aa		0.54	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	AYR1	P40471	297 aa		0.54	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	0.54	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	COG7	P53195	279 aa		0.54	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	YPL077C	Q02831	240 aa		0.54	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	VPS60	Q03390	229 aa		0.54	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	VBA1	Q04301	562 aa		0.54	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	RRG8	Q06109	277 aa		0.54	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	ERG2	P32352	222 aa		0.54	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	YHL049C	P38722	271 aa		0.54	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	YJL118W	P47022	219 aa		0.54	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	COX16	P47081	118 aa		0.54	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	GTO1	P48239	356 aa		0.54	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	NBP35	P52920	328 aa		0.54	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	VOA1	P53262	265 aa		0.54	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	PUT1	P09368	476 aa		0.53	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	0.53	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	POF1	P25576	258 aa		0.53	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	CSM1	P25651	190 aa		0.53	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	KRE6	P32486	720 aa		0.53	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	HIS2	P38635	335 aa		0.53	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	VPS45	P38932	577 aa		0.53	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	FMP33	P46998	180 aa		0.53	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	YGL034C	P53186	121 aa		0.53	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	LSB1	P53281	241 aa		0.53	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	SWS2	P53937	143 aa		0.53	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	RSM10	Q03201	203 aa		0.53	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	YMR209C	Q03648	457 aa		0.53	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	ATC1	Q04005	294 aa		0.53	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	EMI1	Q04406	187 aa		0.53	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	INM2	Q05533	292 aa		0.53	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	GEP5	Q12393	293 aa		0.53	□□□□□ -2.32
SPO21	YOL091W	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	0.52	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	UGA1	P17649	471 aa		0.52	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	0.52	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.52	□□□□□ -2.33	not detected
SPO21	YOL091W	RPC25	P35718	212 aa		0.52	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	0.52	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	0.52	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	YJL028W	P47062	111 aa		0.52	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	SPO19	Q03029	223 aa		0.52	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	TAF9	Q05027	157 aa		0.52	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	MDY2	Q12285	212 aa		0.52	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	RAD3	P06839	778 aa		0.52	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	0.52	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	YOL162W	P0CF19	215 aa		0.52	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	0.52	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	0.52	□□□□□ -2.33

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