RNA–Protein interactions for RNA: YOL083W

ATG34, Transcript of Receptor protein involved in selective autophagy during starvation, yeast

Gene ATG34, Length 1,239 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG34	YOL083W	POM33	Q12164	279 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATG34	YOL083W	COX2	P00410	251 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATG34	YOL083W	TFS1	P14306	219 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATG34	YOL083W	MER1	P16523	270 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATG34	YOL083W	DAL81	P21657	970 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATG34	YOL083W	VPS3	P23643	1011 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATG34	YOL083W	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
ATG34	YOL083W	AEP1	P32493	518 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATG34	YOL083W	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
ATG34	YOL083W	YHL044W	P38727	235 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATG34	YOL083W	FMC1	P40491	155 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATG34	YOL083W	BNA6	P43619	295 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATG34	YOL083W	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
ATG34	YOL083W	SPP2	Q02521	185 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATG34	YOL083W	YPL113C	Q02961	396 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATG34	YOL083W	BTS1	Q12051	335 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATG34	YOL083W	GIS3	Q12418	502 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATG34	YOL083W	ATG31	Q12421	196 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATG34	YOL083W	CFT1	Q06632	1357 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
ATG34	YOL083W	JIP3	O13555	125 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ATG34	YOL083W	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ATG34	YOL083W	IMP1	P28627	190 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ATG34	YOL083W	TCD1	P38756	429 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ATG34	YOL083W	ECM14	P38836	430 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ATG34	YOL083W	OTU1	P43558	301 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ATG34	YOL083W	KAP114	P53067	1004 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ATG34	YOL083W	TPN1	P53099	579 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ATG34	YOL083W	OSH6	Q02201	448 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ATG34	YOL083W	DXO1	Q06349	442 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ATG34	YOL083W	YDL144C	Q07589	356 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ATG34	YOL083W	YPR063C	Q12160	140 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ATG34	YOL083W	YOR029W	Q12243	111 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ATG34	YOL083W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
ATG34	YOL083W	ATG15	P25641	520 aa		2.66	□□□□□ -1.98
ATG34	YOL083W	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
ATG34	YOL083W	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.66	□□□□□ -1.98	not detected
ATG34	YOL083W	KRE29	P40026	464 aa		2.66	□□□□□ -1.98
ATG34	YOL083W	YFR045W	P43617	309 aa		2.66	□□□□□ -1.98
ATG34	YOL083W	PGA2	P53903	129 aa		2.66	□□□□□ -1.98
ATG34	YOL083W	YMR209C	Q03648	457 aa		2.66	□□□□□ -1.98
ATG34	YOL083W	YML018C	Q03730	393 aa		2.66	□□□□□ -1.98
ATG34	YOL083W	GMC2	Q06201	188 aa		2.66	□□□□□ -1.98
ATG34	YOL083W	IES3	Q12345	250 aa		2.66	□□□□□ -1.98
ATG34	YOL083W	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
ATG34	YOL083W	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
ATG34	YOL083W	RAD3	P06839	778 aa		2.65	□□□□□ -1.99
ATG34	YOL083W	PHO80	P20052	293 aa		2.65	□□□□□ -1.99
ATG34	YOL083W	YSR3	P23501	404 aa		2.65	□□□□□ -1.99
ATG34	YOL083W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	2.65	□□□□□ -1.99
ATG34	YOL083W	KRE6	P32486	720 aa		2.65	□□□□□ -1.99
ATG34	YOL083W	SIP3	P38717	1229 aa		2.65	□□□□□ -1.99
ATG34	YOL083W	TDA11	P38854	504 aa		2.65	□□□□□ -1.99
ATG34	YOL083W	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
ATG34	YOL083W	AVT7	P40501	490 aa		2.65	□□□□□ -1.99
ATG34	YOL083W	GIM3	P53900	129 aa		2.65	□□□□□ -1.99
ATG34	YOL083W	MRS2	Q01926	470 aa		2.65	□□□□□ -1.99
ATG34	YOL083W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	2.65	□□□□□ -1.99
ATG34	YOL083W	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	2.65	□□□□□ -1.99
ATG34	YOL083W	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	2.65	□□□□□ -1.99
ATG34	YOL083W	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	2.64	□□□□□ -1.99
ATG34	YOL083W	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ATG34	YOL083W	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ATG34	YOL083W	YAK1	P14680	807 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ATG34	YOL083W	RRT12	P25381	491 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ATG34	YOL083W	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
ATG34	YOL083W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
ATG34	YOL083W	BIG1	P38813	335 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ATG34	YOL083W	SEN34	P39707	275 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ATG34	YOL083W	AVT6	P40074	448 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ATG34	YOL083W	SYS1	P41544	203 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ATG34	YOL083W	ECO1	P43605	281 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ATG34	YOL083W	MRX5	P47007	382 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ATG34	YOL083W	CGR1	P53188	120 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ATG34	YOL083W	YLR283W	Q05867	314 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ATG34	YOL083W	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
ATG34	YOL083W	YOL163W	P0CF20	169 aa		2.63	□□□□□ -1.99
ATG34	YOL083W	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	2.63	□□□□□ -1.99
ATG34	YOL083W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	2.63	□□□□□ -1.99
ATG34	YOL083W	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
ATG34	YOL083W	IBA57	P47158	497 aa		2.63	□□□□□ -1.99
ATG34	YOL083W	SNZ1	Q03148	297 aa		2.63	□□□□□ -1.99
ATG34	YOL083W	VPS60	Q03390	229 aa		2.63	□□□□□ -1.99
ATG34	YOL083W	VBA1	Q04301	562 aa		2.63	□□□□□ -1.99
ATG34	YOL083W	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
ATG34	YOL083W	PAM18	Q07914	168 aa		2.63	□□□□□ -1.99
ATG34	YOL083W	DAL82	P21705	255 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ATG34	YOL083W	TKL2	P33315	681 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ATG34	YOL083W	CAB3	P36076	571 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ATG34	YOL083W	COA1	P40452	197 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ATG34	YOL083W	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	2.62	□□□□□ -1.99
ATG34	YOL083W	YJL144W	P47009	104 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ATG34	YOL083W	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
ATG34	YOL083W	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.62	□□□□□ -1.99	not detected
ATG34	YOL083W	CDC14	Q00684	551 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ATG34	YOL083W	TAF9	Q05027	157 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ATG34	YOL083W	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	2.62	□□□□□ -1.99
ATG34	YOL083W	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
ATG34	YOL083W	LOA1	Q06508	300 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ATG34	YOL083W	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
ATG34	YOL083W	PBN1	P25580	416 aa		2.61	□□□□□ -1.99

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