RNA–Protein interactions for RNA: YMR115W

MGR3, Transcript of Subunit of the mitochondrial (mt) i-AAA protease supercomplex, yeast

Gene MGR3, Length 1,506 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MGR3	YMR115W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
MGR3	YMR115W	PAM18	Q07914	168 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MGR3	YMR115W	TRM10	Q12400	293 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MGR3	YMR115W	ATG31	Q12421	196 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MGR3	YMR115W	QCR6	P00127	147 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MGR3	YMR115W	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
MGR3	YMR115W	NTG1	P31378	399 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MGR3	YMR115W	MBA1	P38300	278 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MGR3	YMR115W	KRE29	P40026	464 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MGR3	YMR115W	RRG9	P40156	214 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MGR3	YMR115W	ASG7	P46993	209 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MGR3	YMR115W	YGL118C	P53132	145 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MGR3	YMR115W	MRPL50	P53724	139 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MGR3	YMR115W	MNT4	P53745	580 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MGR3	YMR115W	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
MGR3	YMR115W	SEC10	Q06245	871 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MGR3	YMR115W	MSH5	Q12175	901 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MGR3	YMR115W	STH1	P32597	1359 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MGR3	YMR115W	DNF2	Q12675	1612 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MGR3	YMR115W	SRB4	P32569	687 aa		3.15	□□□□□ -1.9
MGR3	YMR115W	AIM29	P36154	155 aa		3.15	□□□□□ -1.9
MGR3	YMR115W	MRPL3	P36516	390 aa		3.15	□□□□□ -1.9
MGR3	YMR115W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
MGR3	YMR115W	YIL054W	P40524	105 aa		3.15	□□□□□ -1.9
MGR3	YMR115W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
MGR3	YMR115W	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
MGR3	YMR115W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.9
MGR3	YMR115W	YOS9	Q99220	542 aa		3.15	□□□□□ -1.9
MGR3	YMR115W	CHD1	P32657	1468 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	ATG2	P53855	1592 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	SAC3	P46674	1301 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	YAL064W-B	O13512	126 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	PEX3	P28795	441 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	TCD1	P38756	429 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	AVT7	P40501	490 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	YPL113C	Q02961	396 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	ATG15	P25641	520 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	KRE6	P32486	720 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	YER184C	P39961	794 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	SER33	P40510	469 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	YFL064C	P43540	174 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	MAL13	P53338	473 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	MRS2	Q01926	470 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	YOL085C	Q99345	113 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	EDC2	P40023	145 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	YER085C	P40058	173 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	MIC19	P43594	170 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	RKR1	Q04781	1562 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	ECM19	Q06011	112 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	ZIP1	P31111	875 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	VPH2	P32341	215 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	QRI5	P32344	111 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.12	□□□□□ -1.91	not detected
MGR3	YMR115W	LDB7	P38210	180 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	FRT2	P39734	528 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	UFE1	P41834	346 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	YFL012W	P43580	148 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	CAX4	P53223	239 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	AUS1	Q08409	1394 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	COX10	P21592	462 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	MRX3	P38172	270 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	COQ5	P49017	307 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	LIF1	P53150	421 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	ASI3	P53983	676 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	PIN3	Q06449	215 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	PRM7	Q12459	698 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	RPB9	P27999	122 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	BDH1	P39714	382 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	DSN1	P40568	576 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	YNL095C	P53932	642 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	SWS2	P53937	143 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	LOA1	Q06508	300 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	YDL211C	Q12121	372 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91

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