RNA–Protein interactions for RNA: YLR389C

STE23, Transcript of Metalloprotease, yeast

Gene STE23, Length 3,084 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STE23	YLR389C	GDS1	P41913	522 aa		2.78	□□□□□ -1.96
STE23	YLR389C	TAX4	P47030	604 aa		2.78	□□□□□ -1.96
STE23	YLR389C	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
STE23	YLR389C	MRK1	P50873	501 aa		2.78	□□□□□ -1.96
STE23	YLR389C	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
STE23	YLR389C	RSM24	Q03976	319 aa		2.78	□□□□□ -1.96
STE23	YLR389C	SPC24	Q04477	213 aa		2.78	□□□□□ -1.96
STE23	YLR389C	RRG8	Q06109	277 aa		2.78	□□□□□ -1.96
STE23	YLR389C	IPK1	Q06667	281 aa		2.78	□□□□□ -1.96
STE23	YLR389C	PSF1	Q12488	208 aa		2.78	□□□□□ -1.96
STE23	YLR389C	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		2.78	□□□□□ -1.96
STE23	YLR389C	SCEI	P03882	235 aa		2.78	□□□□□ -1.96
STE23	YLR389C	HEM4	P06174	275 aa		2.78	□□□□□ -1.96
STE23	YLR389C	TOA2	P32774	122 aa		2.78	□□□□□ -1.96
STE23	YLR389C	AIM2	P39721	246 aa		2.78	□□□□□ -1.96
STE23	YLR389C	FMP52	P40008	231 aa		2.78	□□□□□ -1.96
STE23	YLR389C	SNO3	P43544	222 aa		2.78	□□□□□ -1.96
STE23	YLR389C	FMP32	P43557	207 aa		2.78	□□□□□ -1.96
STE23	YLR389C	NUP57	P48837	541 aa		2.78	□□□□□ -1.96
STE23	YLR389C	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
STE23	YLR389C	YLR346C	Q06139	101 aa		2.78	□□□□□ -1.96
STE23	YLR389C	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
STE23	YLR389C	YDL109C	Q12103	647 aa		2.78	□□□□□ -1.96
STE23	YLR389C	SWM1	Q12379	170 aa		2.78	□□□□□ -1.96
STE23	YLR389C	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
STE23	YLR389C	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		2.78	□□□□□ -1.96
STE23	YLR389C	YMR085W	P0CF18	432 aa		2.77	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	APA2	P22108	325 aa		2.77	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	ERG9	P29704	444 aa		2.77	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	GSH1	P32477	678 aa		2.77	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	HSP150	P32478	413 aa		2.77	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	MRPL6	P32904	214 aa		2.77	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	AGP3	P43548	558 aa		2.77	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	YNL095C	P53932	642 aa		2.77	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	NAT4	Q04751	285 aa		2.77	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	MUM3	Q08750	479 aa		2.77	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	MET2	P08465	486 aa		2.77	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		2.77	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	NUP1	P20676	1076 aa		2.77	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	CCA1	P21269	546 aa		2.77	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.77	□□□□□ -1.97	not detected
STE23	YLR389C	PTC1	P35182	281 aa		2.77	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	ELF1	P36053	145 aa		2.77	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	YGL101W	P53144	215 aa		2.77	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	GET1	P53192	235 aa		2.77	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	COX18	P53239	316 aa		2.77	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	BUD17	P53727	317 aa		2.77	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	HHT1	P61830	136 aa		2.77	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	SDC1	Q03323	175 aa		2.77	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	CAB5	Q03941	241 aa		2.77	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	YLR283W	Q05867	314 aa		2.77	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	RNH203	Q12338	110 aa		2.77	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	SPO24	Q3E752	67 aa		2.77	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	MHF1	Q3E835	90 aa		2.77	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	SEC12	P11655	471 aa		2.77	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	ZIP1	P31111	875 aa		2.77	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	TOS2	P50078	622 aa		2.77	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	YIP5	P53108	310 aa		2.77	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	SNX41	Q04053	625 aa		2.77	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	YMR130W	Q04223	302 aa		2.77	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	FAR10	Q06001	478 aa		2.77	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	SGT1	Q08446	395 aa		2.77	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	YDL199C	Q12407	687 aa		2.77	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	YOR343C	Q12484	108 aa		2.77	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		2.77	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	YAK1	P14680	807 aa		2.76	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	MAK32	P23060	363 aa		2.76	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	ITR2	P30606	609 aa		2.76	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	PHB1	P40961	287 aa		2.76	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	YDL186W	P48568	277 aa		2.76	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	PMT5	P52867	743 aa		2.76	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	COG5	P53951	403 aa		2.76	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	NRG1	Q03125	231 aa		2.76	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	RNH202	Q05635	350 aa		2.76	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	IRC19	Q07843	230 aa		2.76	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	YLR036C	Q07986	203 aa		2.76	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	MED2	Q12124	431 aa		2.76	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	RAD7	P06779	565 aa		2.76	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	NFT1	P0CE68	1218 aa		2.76	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	CMK2	P22517	447 aa		2.76	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	VMA16	P23968	213 aa		2.76	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	CLB2	P24869	491 aa		2.76	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	SNC1	P31109	117 aa		2.76	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	ECM4	P36156	370 aa		2.76	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	MTW1	P39731	289 aa		2.76	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	BUR6	P40096	142 aa		2.76	□□□□□ -1.97
STE23	YLR389C	GAT2	P40209	560 aa		2.76	□□□□□ -1.97

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21.4 ms