RNA–Protein interactions for RNA: YHR139C

SPS100, Transcript of Protein required for spore wall maturation, yeast

Gene SPS100, Length 981 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPS100	YHR139C	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	7.62	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	MCT1	Q12283	360 aa		7.62	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	NUM1	Q00402	2748 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	ATG15	P25641	520 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	KRE6	P32486	720 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	FRM2	P37261	193 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	YBR096W	P38256	230 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	SEN34	P39707	275 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	AAD14	P42884	376 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	LOH1	P47055	219 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	NIT3	P49954	291 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	YGL204C	P53089	101 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	CPR8	P53728	308 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	RCE1	Q03530	315 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	BRE4	Q07660	1125 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	RPL43B	P0CX26	92 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	CLB2	P24869	491 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	ERG4	P25340	473 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	PAU2	P32612	120 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	MRPS5	P33759	307 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	MOB2	P43563	287 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	MTM1	P53320	366 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	TNA1	P53322	534 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	YNL092W	P53934	400 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	SAM50	P53969	484 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	YLR152C	P54072	576 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	THI72	Q08579	599 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	RCN2	Q12044	265 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	IZH2	Q12442	317 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	7.6	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	QCR7	P00128	127 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	COX5B	P00425	151 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	SOD2	P00447	233 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.59	□□□□□ -1.19	not detected
SPS100	YHR139C	SDS24	P38314	527 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	YER084W	P40057	128 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	PUG1	P40100	303 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	TOK1	P40310	691 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	YJR120W	P47157	116 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	RSM23	Q01163	450 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	SSK1	Q07084	712 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	WTM2	Q12206	467 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	GCN4	P03069	281 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	NAM2	P11325	894 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	CLG1	P35190	452 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	SFK1	P35735	353 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	CCZ1	P38273	704 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	YBR137W	P38276	179 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	RTT105	P40063	208 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	DLS1	P40366	167 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	YJL055W	P47044	245 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	DOC1	P53068	250 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	AAH1	P53909	347 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	TDA1	Q03533	586 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	MSS11	Q03825	758 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	ASR1	Q06834	288 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	YHL037C	P38733	133 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	ATG18	P43601	500 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	NRK1	P53915	240 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	CIK1	Q01649	594 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	RSM28	Q03430	361 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	PEX27	Q08580	376 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	SOG2	Q08817	791 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	SUS1	Q6WNK7	96 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	RPN13	O13563	156 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	HIS3	P06633	220 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	RCN1	P36054	211 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	APL3	P38065	1025 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	TAT1	P38085	619 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	YFL051C	P43552	160 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	CTK2	P46962	323 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	YJL016W	P47072	561 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	SIP18	P50263	79 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	YIP4	P53093	235 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	SLI1	P53304	468 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	ACS1	Q01574	713 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	API2	Q04413	109 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	PEX30	Q06169	523 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2

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