RNA–Protein interactions for RNA: YER118C

SHO1, Transcript of Transmembrane osmosensor for filamentous growth and HOG pathways, yeastyeast

Gene SHO1, Length 1,104 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHO1YER118C TFC7Q12415 435 aa5.67□□□□□ -1.5
SHO1YER118C FOL3Q12676 427 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
SHO1YER118C RPN13O13563 156 aa5.66□□□□□ -1.5
SHO1YER118C DPM1P14020 267 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
SHO1YER118C SGE1P33335 543 aa5.66□□□□□ -1.5
SHO1YER118C THI80P35202 319 aa5.66□□□□□ -1.5
SHO1YER118C GOS1P38736 223 aa5.66□□□□□ -1.5
SHO1YER118C SER33P40510 469 aa5.66□□□□□ -1.5
SHO1YER118C NBP35P52920 328 aa5.66□□□□□ -1.5
SHO1YER118C NQM1P53228 333 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
SHO1YER118C NUP49Q02199 472 aa5.66□□□□□ -1.5
SHO1YER118C DXO1Q06349 442 aa5.66□□□□□ -1.5
SHO1YER118C RSA1Q08932 381 aa5.66□□□□□ -1.5
SHO1YER118C TPO4Q12256 659 aa5.66□□□□□ -1.5
SHO1YER118C NOT5Q12514 560 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
SHO1YER118C IFM1P25038 676 aa5.65□□□□□ -1.5
SHO1YER118C AGA1P32323 725 aa5.65□□□□□ -1.5
SHO1YER118C ALK2P32789 676 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
SHO1YER118C SIP2P34164 415 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
SHO1YER118C KTI12P34253 313 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
SHO1YER118C YBR137WP38276 179 aa5.65□□□□□ -1.5
SHO1YER118C YHR127WP38833 243 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
SHO1YER118C MTC6P38849 526 aa5.65□□□□□ -1.5
SHO1YER118C YJR056CP47115 236 aa5.65□□□□□ -1.5
SHO1YER118C YNR066CP53752 436 aa5.65□□□□□ -1.5
SHO1YER118C TIM44Q01852 431 aa5.65□□□□□ -1.5
SHO1YER118C GMC1Q04399 608 aa5.65□□□□□ -1.5
SHO1YER118C NOC4Q06512 552 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
SHO1YER118C DTD1Q07648 150 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
SHO1YER118C COQ10Q08058 207 aa5.65□□□□□ -1.5
SHO1YER118C USB1Q12208 290 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
SHO1YER118C YGK3Q12222 375 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
SHO1YER118C HIR3P47171 1648 aa5.65□□□□□ -1.51
SHO1YER118C YAL064W-BO13512 126 aa5.64□□□□□ -1.51
SHO1YER118C ISY1P21374 235 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
SHO1YER118C MRPL3P36516 390 aa5.64□□□□□ -1.51
SHO1YER118C COX14P39103 70 aa5.64□□□□□ -1.51
SHO1YER118C PRM10P42946 383 aa5.64□□□□□ -1.51
SHO1YER118C MCM22P47167 239 aa5.64□□□□□ -1.51
SHO1YER118C PDR17P53844 350 aa5.64□□□□□ -1.51
SHO1YER118C ABF2Q02486 183 aa5.64□□□□□ -1.51
SHO1YER118C YML096WQ04489 525 aa5.64□□□□□ -1.51
SHO1YER118C GRX8Q05926 109 aa5.64□□□□□ -1.51
SHO1YER118C RFM1Q12192 310 aa5.64□□□□□ -1.51
SHO1YER118C MCT1Q12283 360 aa5.64□□□□□ -1.51
SHO1YER118C RPS28BP0C0X0 67 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
SHO1YER118C RPL23AP0CX41 137 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
SHO1YER118C RPL23BP0CX42 137 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
SHO1YER118C YCR022CP25620 114 aa5.63□□□□□ -1.51
SHO1YER118C RRP3P38712 501 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
SHO1YER118C MRPL49P40858 161 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
SHO1YER118C YFH7P43591 353 aa5.63□□□□□ -1.51
SHO1YER118C YGL204CP53089 101 aa5.63□□□□□ -1.51
SHO1YER118C SUR7P54003 302 aa5.63□□□□□ -1.51
SHO1YER118C YMR279CQ03263 540 aa5.63□□□□□ -1.51
SHO1YER118C SCS7Q03529 384 aa5.63□□□□□ -1.51
SHO1YER118C YET2Q04210 160 aa5.63□□□□□ -1.51
SHO1YER118C ORM2Q06144 216 aa5.63□□□□□ -1.51
SHO1YER118C YLR053CQ12026 108 aa5.63□□□□□ -1.51
SHO1YER118C YDL199CQ12407 687 aa5.63□□□□□ -1.51
SHO1YER118C AGC1Q12482 902 aa5.63□□□□□ -1.51
SHO1YER118C RPS28AQ3E7X9 67 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
SHO1YER118C HEM4P06174 275 aa5.62□□□□□ -1.51
SHO1YER118C PIS1P06197 220 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
SHO1YER118C MET2P08465 486 aa5.62□□□□□ -1.51
SHO1YER118C YOL163WP0CF20 169 aa5.62□□□□□ -1.51
SHO1YER118C URE2P23202 354 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
SHO1YER118C HOT13P36078 116 aa5.62□□□□□ -1.51
SHO1YER118C OMA1P36163 345 aa5.62□□□□□ -1.51
SHO1YER118C MED8P38304 223 aa5.62□□□□□ -1.51
SHO1YER118C ARC40P38328 384 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
SHO1YER118C YAP3P38749 330 aa5.62□□□□□ -1.51
SHO1YER118C MDM31P38880 579 aa5.62□□□□□ -1.51
SHO1YER118C PET8P38921 284 aa5.62□□□□□ -1.51
SHO1YER118C ATP23P53722 227 aa5.62□□□□□ -1.51
SHO1YER118C PIR3Q03180 325 aa5.62□□□□□ -1.51
SHO1YER118C YML018CQ03730 393 aa5.62□□□□□ -1.51
SHO1YER118C YMR315WQ04869 349 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
SHO1YER118C INM2Q05533 292 aa5.62□□□□□ -1.51
SHO1YER118C XRN1P22147 1528 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
SHO1YER118C DBF2P22204 572 aa5.61□□□□□ -1.51
SHO1YER118C AEP1P32493 518 aa5.61□□□□□ -1.51
SHO1YER118C MRPL28P36527 147 aa5.61□□□□□ -1.51
SHO1YER118C EDC3P39998 551 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
SHO1YER118C YGL039WP53183 348 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
SHO1YER118C SEI1Q06058 285 aa5.61□□□□□ -1.51
SHO1YER118C YLR050CQ12155 161 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
SHO1YER118C EAF3Q12432 401 aa5.61□□□□□ -1.51
SHO1YER118C MRX4Q12467 430 aa5.61□□□□□ -1.51
SHO1YER118C CSR2Q12734 1121 aa5.61□□□□□ -1.51
SHO1YER118C BI3Q9ZZW7 517 aa5.61□□□□□ -1.51
SHO1YER118C MDH3P32419 343 aaKnown RBP RIP-Chip data5.6□□□□□ -1.51not detected
SHO1YER118C RCK1P38622 512 aa5.6□□□□□ -1.51
SHO1YER118C VMA22P38784 181 aa5.6□□□□□ -1.51
SHO1YER118C YER076CP40049 302 aa5.6□□□□□ -1.51
SHO1YER118C YIL029CP40538 142 aa5.6□□□□□ -1.51
SHO1YER118C OST1P41543 476 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
SHO1YER118C AZF1P41696 914 aa5.6□□□□□ -1.51
SHO1YER118C LCB3P47013 409 aa5.6□□□□□ -1.51
SHO1YER118C IKS1P47042 667 aa5.6□□□□□ -1.51
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