RNA–Protein interactions for RNA: YER103W

SSA4, Transcript of Heat shock protein that is highly induced upon stress, yeastyeast

Gene SSA4, Length 1,929 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSA4YER103W NEO1P40527 1151 aa11.63□□□□□ -0.55
SSA4YER103W LYS20P48570 428 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SSA4YER103W CDH1P53197 566 aa11.63□□□□□ -0.55
SSA4YER103W TAZ1Q06510 381 aa11.63□□□□□ -0.55
SSA4YER103W AVO1Q08236 1176 aa11.63□□□□□ -0.55
SSA4YER103W MGM101P32787 269 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
SSA4YER103W ECM15P35195 104 aa11.62□□□□□ -0.55
SSA4YER103W GCS1P35197 352 aa11.62□□□□□ -0.55
SSA4YER103W SPT10P35208 640 aa11.62□□□□□ -0.55
SSA4YER103W GMH1P36125 273 aa11.62□□□□□ -0.55
SSA4YER103W GPI16P38875 610 aa11.62□□□□□ -0.55
SSA4YER103W YJR056CP47115 236 aa11.62□□□□□ -0.55
SSA4YER103W NAT4Q04751 285 aa11.62□□□□□ -0.55
SSA4YER103W RRT7Q07829 113 aa11.62□□□□□ -0.55
SSA4YER103W YOR352WQ08816 343 aa11.62□□□□□ -0.55
SSA4YER103W MRPL27P36526 146 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
SSA4YER103W SAF1P38352 637 aa11.62□□□□□ -0.55
SSA4YER103W TRR2P38816 342 aa11.62□□□□□ -0.55
SSA4YER103W JHD1P40034 492 aa11.62□□□□□ -0.55
SSA4YER103W CIN2P46670 268 aa11.62□□□□□ -0.55
SSA4YER103W YGL204CP53089 101 aa11.62□□□□□ -0.55
SSA4YER103W YNR021WP53723 404 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
SSA4YER103W MED7Q08278 222 aa11.62□□□□□ -0.55
SSA4YER103W RPL25P04456 142 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
SSA4YER103W ADK2P26364 225 aa11.61□□□□□ -0.55
SSA4YER103W SNC2P33328 115 aa11.61□□□□□ -0.55
SSA4YER103W MRPL4P36517 319 aa11.61□□□□□ -0.55
SSA4YER103W AIM3P38266 947 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
SSA4YER103W SHG1P38337 142 aa11.61□□□□□ -0.55
SSA4YER103W GET2P40056 285 aa11.61□□□□□ -0.55
SSA4YER103W YNL195CP40168 261 aa11.61□□□□□ -0.55
SSA4YER103W HXT14P42833 540 aa11.61□□□□□ -0.55
SSA4YER103W SFH5P47008 294 aa11.61□□□□□ -0.55
SSA4YER103W SAM37P50110 327 aa11.61□□□□□ -0.55
SSA4YER103W RNH70P53331 553 aa11.61□□□□□ -0.55
SSA4YER103W PUS5Q06244 254 aa11.61□□□□□ -0.55
SSA4YER103W YCL001W-BQ96VH2 84 aa11.61□□□□□ -0.55
SSA4YER103W ODC2Q99297 307 aa11.61□□□□□ -0.55
SSA4YER103W MCK1P21965 375 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
SSA4YER103W PBN1P25580 416 aa11.6□□□□□ -0.55
SSA4YER103W PPZ2P33329 710 aa11.6□□□□□ -0.55
SSA4YER103W NTF2P33331 125 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
SSA4YER103W ECM34P38728 170 aa11.6□□□□□ -0.55
SSA4YER103W GIM4P40005 111 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
SSA4YER103W ADO1P47143 340 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
SSA4YER103W YMR178WQ03219 274 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
SSA4YER103W RPS21BQ3E754 87 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
SSA4YER103W AFR1P33304 620 aa11.6□□□□□ -0.55
SSA4YER103W MRPL28P36527 147 aa11.6□□□□□ -0.55
SSA4YER103W SDS24P38314 527 aa11.6□□□□□ -0.55
SSA4YER103W YIL161WP40449 235 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
SSA4YER103W SYS1P41544 203 aa11.6□□□□□ -0.55
SSA4YER103W AVT4P50944 713 aa11.6□□□□□ -0.55
SSA4YER103W NIF3P53081 288 aa11.6□□□□□ -0.55
SSA4YER103W HCH1P53834 153 aa11.6□□□□□ -0.55
SSA4YER103W BSP1Q06604 576 aa11.6□□□□□ -0.55
SSA4YER103W YPQ1Q12010 308 aa11.6□□□□□ -0.55
SSA4YER103W COX19Q3E731 98 aa11.6□□□□□ -0.55
SSA4YER103W CHO1P08456 276 aa11.59□□□□□ -0.55
SSA4YER103W CDC50P25656 391 aa11.59□□□□□ -0.55
SSA4YER103W RFA2P26754 273 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
SSA4YER103W PRP39P39682 629 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
SSA4YER103W YGL114WP53134 725 aa11.59□□□□□ -0.55
SSA4YER103W EGD1Q02642 157 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
SSA4YER103W SEC13Q04491 297 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
SSA4YER103W TMA10Q06177 86 aa11.59□□□□□ -0.55
SSA4YER103W ATX2Q12067 313 aa11.59□□□□□ -0.55
SSA4YER103W RTK1Q12100 620 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
SSA4YER103W GLO4Q12320 285 aa11.59□□□□□ -0.55
SSA4YER103W HMS1Q12398 434 aa11.59□□□□□ -0.55
SSA4YER103W YLR146W-AQ2V2P1 62 aa11.59□□□□□ -0.55
SSA4YER103W CBS1P14066 229 aa11.58□□□□□ -0.55
SSA4YER103W POT1P27796 417 aaKnown RBP RIP-Chip data11.58□□□□□ -0.55not detected
SSA4YER103W RRN10P38204 145 aa11.58□□□□□ -0.55
SSA4YER103W YPT31P38555 223 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.55
SSA4YER103W PAU15P40585 124 aa11.58□□□□□ -0.55
SSA4YER103W UBP8P50102 471 aa11.58□□□□□ -0.55
SSA4YER103W YIF1P53845 314 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.55
SSA4YER103W AIM6Q07716 390 aa11.58□□□□□ -0.55
SSA4YER103W SCL1P21243 252 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
SSA4YER103W YSR3P23501 404 aa11.58□□□□□ -0.56
SSA4YER103W PPH21P23594 369 aa11.58□□□□□ -0.56
SSA4YER103W NFS1P25374 497 aa11.58□□□□□ -0.56
SSA4YER103W RIB5P38145 238 aa11.58□□□□□ -0.56
SSA4YER103W YIL108WP40483 696 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
SSA4YER103W SLS1P42900 643 aa11.58□□□□□ -0.56
SSA4YER103W SGF73P53165 657 aa11.58□□□□□ -0.56
SSA4YER103W SMX3P54999 86 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
SSA4YER103W CUE4Q04201 117 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
SSA4YER103W MRX9Q07349 420 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
SSA4YER103W YDL211CQ12121 372 aa11.58□□□□□ -0.56
SSA4YER103W GAL4P04386 881 aa11.57□□□□□ -0.56
SSA4YER103W MRPL16P38064 232 aa11.57□□□□□ -0.56
SSA4YER103W FLX1P40464 311 aa11.57□□□□□ -0.56
SSA4YER103W CTF19Q02732 369 aa11.57□□□□□ -0.56
SSA4YER103W FUR4P05316 633 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
SSA4YER103W MET30P39014 640 aa11.56□□□□□ -0.56
SSA4YER103W YDR415CQ04033 374 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
SSA4YER103W BRX1Q08235 291 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
SSA4YER103W ERG27Q12452 347 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
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