RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 RAI14Q9P0K7 980 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 SERPINB13Q9UIV8 391 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 PILRBQ9UKJ0 227 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 PALD1Q9ULE6 856 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 NCANO14594 1321 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 SDK1Q7Z5N4 2213 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP2.31□□□□□ -2.04
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RNU6-548P-201ENST00000517083 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 TACC2O95359 2948 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 DENND4AQ7Z401 1863 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa2.3□□□□□ -2.04
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RNU6-548P-201ENST00000517083 EFSO43281 561 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 ECI2O75521 394 aa2.3□□□□□ -2.04
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RNU6-548P-201ENST00000517083 APBB3O95704 486 aa2.3□□□□□ -2.04
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RNU6-548P-201ENST00000517083 SCG2P13521 617 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 ITGB5P18084 799 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 KLRC2P26717 231 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 MEOX1P50221 254 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 CLCN4P51793 760 aa2.3□□□□□ -2.04
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RNU6-548P-201ENST00000517083 ERVPABLB-1P60509 514 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 PPP2R2BQ00005 443 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 MECOMQ03112 1051 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 ICA1Q05084 483 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 PDE4DQ08499 809 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 MFSD10Q14728 455 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 GRM4Q14833 912 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 KIZQ2M2Z5 673 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 CCDC30Q5VVM6 783 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 DUSP27Q5VZP5 1158 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 C1orf228Q6PIY5 440 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 ADGRD1Q6QNK2 874 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM179Q6ZVK1 233 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 CHST3Q7LGC8 479 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 RABEPKQ7Z6M1 372 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 RSPH3Q86UC2 560 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 SERINC5Q86VE9 423 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF280BQ86YH2 543 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 NOSTRINQ8IVI9 506 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 VPS52Q8N1B4 723 aa2.3□□□□□ -2.04
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RNU6-548P-201ENST00000517083 NINJ1Q92982 152 aa2.3□□□□□ -2.04
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RNU6-548P-201ENST00000517083 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 ADAM2Q99965 735 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 TPSD1Q9BZJ3 242 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRIM8Q9BZR9 551 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 VCPKMTQ9H867 229 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 THSD1Q9NS62 852 aa2.3□□□□□ -2.04
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RNU6-548P-201ENST00000517083 EBF1Q9UH73 591 aa2.3□□□□□ -2.04
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RNU6-548P-201ENST00000517083 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP2.3□□□□□ -2.04
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RNU6-548P-201ENST00000517083 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 FLT1P17948 1338 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 KIAA1671Q9BY89 1806 aa2.3□□□□□ -2.04
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RNU6-548P-201ENST00000517083 DCHS2Q6V1P9 2916 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 ANK2Q01484 3957 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPAG17Q6Q759 2223 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 DLG5Q8TDM6 1919 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 HERC2O95714 4834 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 A0A1W2PRG0 241 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 ESYT2A0FGR8 921 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 INAFM1C9JVW0 142 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 M0QZ92 97 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 ATG13O75143 517 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 DXOO77932 396 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 REC8O95072 547 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 VENTXO95231 258 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 GH1P01241 217 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF286BP0CG31 522 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 COX6B1P14854 86 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 GLDCP23378 1020 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 SSTR2P30874 369 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 CDR1P51861 262 aa2.29□□□□□ -2.04
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