RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 KIR2DL3P43628 341 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRC-212ENST00000491302 AK2P54819 239 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRC-212ENST00000491302 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF827Q17R98 1081 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRC-212ENST00000491302 ZMAT1Q5H9K5 638 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRC-212ENST00000491302 MAEAQ7L5Y9 396 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRC-212ENST00000491302 PQLC1Q8N2U9 271 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRC-212ENST00000491302 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRC-212ENST00000491302 PTPN18Q99952 460 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRC-212ENST00000491302 OR10A2Q9H208 303 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRC-212ENST00000491302 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRC-212ENST00000491302 MTSS1O43312 755 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRC-212ENST00000491302 MGEA5O60502 916 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRC-212ENST00000491302 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PTPRC-212ENST00000491302 MED14OSP0DP75 135 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRC-212ENST00000491302 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
PTPRC-212ENST00000491302 HTR3AP46098 478 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRC-212ENST00000491302 NOGQ13253 232 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRC-212ENST00000491302 USP10Q14694 798 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PTPRC-212ENST00000491302 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP9.6□□□□□ -0.87
PTPRC-212ENST00000491302 KLHL36Q8N4N3 616 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRC-212ENST00000491302 NUP62CLQ9H1M0 184 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRC-212ENST00000491302 LANCL2Q9NS86 450 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRC-212ENST00000491302 KLHL11Q9NVR0 708 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRC-212ENST00000491302 GPRC5DQ9NZD1 345 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRC-212ENST00000491302 PHTF1Q9UMS5 762 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRC-212ENST00000491302 SH3D21A4FU49 640 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRC-212ENST00000491302 RFXAPO00287 272 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRC-212ENST00000491302 GYPEP15421 78 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRC-212ENST00000491302 SLC6A9P48067 706 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRC-212ENST00000491302 SARSP49591 514 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRC-212ENST00000491302 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
PTPRC-212ENST00000491302 GADL1Q6ZQY3 521 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRC-212ENST00000491302 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRC-212ENST00000491302 LRTOMTQ8WZ04 291 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRC-212ENST00000491302 GJA10Q969M2 543 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRC-212ENST00000491302 MRGPRX4Q96LA9 322 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRC-212ENST00000491302 SAMD11Q96NU1 681 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRC-212ENST00000491302 BHMT2Q9H2M3 363 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRC-212ENST00000491302 LMBRD1Q9NUN5 540 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM140Q9NV12 185 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRC-212ENST00000491302 TRPS1Q9UHF7 1281 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRC-212ENST00000491302 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRC-212ENST00000491302 SIK3Q9Y2K2 1263 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRC-212ENST00000491302 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRC-212ENST00000491302 C2orf78A6NCI8 922 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 C9orf118A6NHY6 69 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 NRP1O14786 923 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 JUNP05412 331 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 PEX2P28328 305 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 SREBF1P36956 1147 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 FGL2Q14314 439 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 AGBL4Q5VU57 503 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 CCHCR1Q8TD31 782 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 FAM84AQ96KN4 292 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 MYD88Q99836 296 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 JADE2Q9NQC1 790 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 ADAM29Q9UKF5 820 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 CFAP69A5D8W1 941 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 TCAF2A6NFQ2 919 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 PI3P19957 117 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 RAB1AP62820 205 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 DUSP2Q05923 314 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP9.57□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 GAGE13Q4V321 117 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 VWA3BQ502W6 1294 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF385BQ569K4 471 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 FAM26FQ5R3K3 315 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 USP30Q70CQ3 517 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 MORC1Q86VD1 984 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 KRT78Q8N1N4 520 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 TMX3Q96JJ7 454 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 PPP1R16BQ96T49 567 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 SPATA25Q9BR10 227 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 PDCD2LQ9BRP1 358 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 SLC6A15Q9H2J7 730 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 NLRC4Q9NPP4 1024 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 PNPOQ9NVS9 261 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 ING3Q9NXR8 418 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 H3BUI4 141 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 FRS3O43559 492 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 TOX4O94842 621 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 FTH1P19P0C7X4 201 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 VSIG10L2P0DP72 767 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 SLC5A1P13866 664 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 SYN1P17600 705 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 RPL17P18621 184 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 SMARCA1P28370 1054 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 CSF2RBP32927 897 aa9.56□□□□□ -0.88
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