RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293826.4

TNFSF12-TNFSF13-201, Transcript of TNFSF12-TNFSF13 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFSF12-TNFSF13, Length 1,816 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CHRNA1P02708 482 aa26■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TPM1P09493 284 aa26■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 EPB41P11171 864 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ATF7IP2Q5U623 682 aa26■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZPBP2Q6X784 338 aa26■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa26■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TRIM59Q8IWR1 403 aa26■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NME8Q8N427 588 aa26■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCDC155Q8N6L0 562 aa26■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa26■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GARTP22102 1010 aa26■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MARSP56192 900 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM187BQ17R55 369 aa26■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TMEM132AQ24JP5 1023 aa26■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM213AQ9BRX8 229 aa26■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 A0A0B4J269 797 aa25.99■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GNA14O95837 355 aa25.99■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ACOT2P49753 483 aa25.99■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa25.99■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TMEM139Q8IV31 216 aa25.99■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PLEKHO2Q8TD55 490 aa25.99■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TMEM174Q8WUU8 243 aa25.99■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PTPRHQ9HD43 1115 aa25.99■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa25.98■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 STX10O60499 249 aa25.98■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TOM1L1O75674 476 aa25.98■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GYPCP04921 128 aa25.98■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PROZP22891 400 aa25.98■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CDK7P50613 346 aa25.98■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MGAT3Q09327 533 aa25.98■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PTK7Q13308 1070 aa25.98■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MYBPC2Q14324 1141 aa25.98■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FRMD5Q7Z6J6 570 aa25.98■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CNGA4Q8IV77 575 aa25.98■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CPLX3Q8WVH0 158 aa25.98■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCDC51Q96ER9 411 aa25.98■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TCHPQ9BT92 498 aa25.98■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MSTO1Q9BUK6 570 aa25.98■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CLDN3O15551 220 aa25.98■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MFAP3LO75121 409 aa25.98■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ERLIN2O94905 339 aa25.98■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DLG4P78352 724 aa25.98■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MAN2A1Q16706 1144 aa25.98■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 VWA3BQ502W6 1294 aa25.98■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CEP120Q8N960 986 aa25.98■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MCOLN1Q9GZU1 580 aa25.98■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PDZD7Q9H5P4 517 aa25.98■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TRPV2Q9Y5S1 764 aa25.98■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TRIM49P0CI25 452 aa25.97■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TRIM49CP0CI26 452 aa25.97■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CASP14P31944 242 aa25.97■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TNFSF9P41273 254 aa25.97■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GJA8P48165 433 aa25.97■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 WNT7BP56706 349 aa25.97■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CDC42EP1Q00587 391 aa25.97■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FKBP15Q5T1M5 1219 aa25.97■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CATSPER4Q7RTX7 472 aa25.97■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RSPH3Q86UC2 560 aa25.97■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GPD1LQ8N335 351 aa25.97■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM84AQ96KN4 292 aa25.97■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MKNK1Q9BUB5 465 aa25.97■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NDST4Q9H3R1 872 aa25.97■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ARHGAP6O43182 974 aa25.96■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM189A1O60320 539 aa25.96■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF568Q3ZCX4 644 aa25.96■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TCERG1LQ5VWI1 586 aa25.96■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLFN12LQ6IEE8 588 aa25.96■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MPZL3Q6UWV2 235 aa25.96■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FBXL18Q96ME1 805 aa25.96■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CDT1Q9H211 546 aa25.96■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TNFSF13BQ9Y275 285 aa25.96■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP25.96■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP25.95■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MCL1Q07820 350 aa25.95■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF618Q5T7W0 954 aa25.95■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RPAINQ86UA6 219 aa25.95■■□□□ 1.75
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM228AQ86W67 206 aa25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms