RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000063006.11

Ccdc42-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Ccdc42, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Depdc1bQ8BH88 529 aa9.98□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 GlmnQ8BZM1 596 aa9.98□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Efl1Q8C0D5 1127 aa9.98□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rapgef5Q8C0Q9 814 aa9.98□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ago2Q8CJG0 860 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dnajc17Q91WT4 303 aa9.98□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Q91Z58 1206 aa9.98□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Smc1bQ920F6 1248 aa9.98□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Atp6v0a4Q920R6 833 aa9.98□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tlr3Q99MB1 905 aa9.98□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zfp623Q9CY99 499 aa9.98□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Trmt10bQ9D075 318 aa9.98□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cfap57Q9D180 1249 aa9.98□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tekt1Q9DAJ2 418 aa9.98□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Eif4e3Q9DBB5 207 aa9.98□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nup50Q9JIH2 466 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Kcnd2Q9Z0V2 630 aa9.98□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zkscan5Q9Z1D8 819 aa9.98□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Adgrf5G5E8Q8 1348 aa9.98□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tmigd3G3X8R9 209 aa9.97□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tnfrsf11aO35305 625 aa9.97□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Trdmt1O55055 415 aa9.97□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pja1O55176 578 aa9.97□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mdh1P14152 334 aa9.97□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tmod1P49813 359 aa9.97□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Actn4P57780 912 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Meis3P97368 378 aa9.97□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Muc1Q02496 630 aa9.97□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cul4aQ3TCH7 759 aa9.97□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rnf157Q3TEL6 685 aa9.97□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Erich4Q3UNU4 136 aa9.97□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ppp2r5eQ61151 467 aa9.97□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Irak1Q62406 710 aa9.97□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 NrcamQ810U4 1256 aa9.97□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dusp4Q8BFV3 398 aa9.97□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tmem117Q8BH18 514 aa9.97□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 F13a1Q8BH61 732 aa9.97□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc26a6Q8CIW6 758 aa9.97□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Trib2Q8K4K3 343 aa9.97□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Creb3l3Q91XE9 479 aa9.97□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Prmt7Q922X9 692 aa9.97□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ddx50Q99MJ9 734 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ctnnbl1Q9CWL8 563 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ears2Q9CXJ1 523 aa9.97□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Satl1Q9D5N8 744 aa9.97□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tbx20Q9ES03 445 aa9.97□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pdk2Q9JK42 407 aa9.97□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rnf103Q9R1W3 683 aa9.97□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Trim10Q9WUH5 489 aa9.97□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc26a3Q9WVC8 757 aa9.97□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm45261A0A1B0GSP6 197 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm11549A0A286YD83 63 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 ZxdbA2CE44 873 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Btnl4A2CG29 586 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm14525B1AZA0 212 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm2012B1B0R1 212 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm2030D3Z7C4 212 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sema4dO09126 861 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Kif3cO35066 796 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Prl6a1O35257 230 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc6a20bO88575 635 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mt-CybP00158 381 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 P01734 135 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cdc25cP48967 447 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 DmpkP54265 631 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ppp3caP63328 521 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 KhsrpQ3U0V1 748 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ccdc34Q3UI66 367 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sec31aQ3UPL0 1230 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 ItgadQ3V0T4 1168 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Miga1Q4QQM5 600 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sema5bQ60519 1093 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm14819Q62478 212 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nudt16Q6P3D0 195 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Snx19Q6P4T1 997 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Frmd5Q6P5H6 517 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Naa15Q80UM3 865 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rnaseh2bQ80ZV0 308 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Frmd3Q8BHD4 595 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Kctd6Q8BNL5 237 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Prpf31Q8CCF0 499 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mamdc2Q8CG85 686 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mmgt1Q8K273 131 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Scrn2Q8VCA8 425 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ttc8Q8VD72 515 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ddx39aQ8VDW0 427 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pcdha9Q91Y11 979 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dcbld2Q91ZV3 769 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Syt17Q920M7 470 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ubxn1Q922Y1 297 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 IscuQ9D7P6 168 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 DcpsQ9DAR7 338 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Xrn2Q9DBR1 951 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tlr2Q9QUN7 784 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Atp1a4Q9WV27 1032 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gfpt2Q9Z2Z9 682 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nlrc5C3VPR6 1915 aa9.95□□□□□ -0.82
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Wfdc16A2A5H4 111 aa9.95□□□□□ -0.82
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fam71aB7XG49 585 aa9.95□□□□□ -0.82
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm4297D3YWB7 211 aa9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33.3 ms