Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37,25■■■■□ 3,55
Pja1O55176 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,84■■■■□ 3,49
Pja1O55176 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,61■■■■□ 3,29
Pja1O55176 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,56■■■■□ 3,28
Pja1O55176 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34,45■■■■□ 3,11
Pja1O55176 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34,01■■■■□ 3,03
Pja1O55176 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,92■■■■□ 3,02
Pja1O55176 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,62■■■□□ 2,97
Pja1O55176 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,54■■■□□ 2,96
Pja1O55176 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,53■■■□□ 2,96
Pja1O55176 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33,42■■■□□ 2,94
Pja1O55176 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,23■■■□□ 2,91
Pja1O55176 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,17■■■□□ 2,9
Pja1O55176 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32,99■■■□□ 2,87
Pja1O55176 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,97■■■□□ 2,87
Pja1O55176 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,96■■■□□ 2,87
Pja1O55176 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,92■■■□□ 2,86
Pja1O55176 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32,9■■■□□ 2,86
Pja1O55176 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,79
Pja1O55176 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
Pja1O55176 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,17■■■□□ 2,74
Pja1O55176 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,17■■■□□ 2,74
Pja1O55176 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,16■■■□□ 2,74
Pja1O55176 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,07■■■□□ 2,72
Pja1O55176 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32,05■■■□□ 2,72
Pja1O55176 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,01■■■□□ 2,71
Pja1O55176 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2,71
Pja1O55176 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,97■■■□□ 2,71
Pja1O55176 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,95■■■□□ 2,7
Pja1O55176 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31,94■■■□□ 2,7
Pja1O55176 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,86■■■□□ 2,69
Pja1O55176 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31,81■■■□□ 2,68
Pja1O55176 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,8■■■□□ 2,68
Pja1O55176 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31,67■■■□□ 2,66
Pja1O55176 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,64■■■□□ 2,65
Pja1O55176 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,62■■■□□ 2,65
Pja1O55176 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31,57■■■□□ 2,64
Pja1O55176 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31,52■■■□□ 2,64
Pja1O55176 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,38■■■□□ 2,61
Pja1O55176 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31,26■■■□□ 2,59
Pja1O55176 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Pja1O55176 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31,23■■■□□ 2,59
Pja1O55176 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31,2■■■□□ 2,59
Pja1O55176 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
Pja1O55176 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,1■■■□□ 2,57
Pja1O55176 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
Pja1O55176 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Pja1O55176 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Pja1O55176 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Pja1O55176 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30,8■■■□□ 2,52
Pja1O55176 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,51
Pja1O55176 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30,67■■■□□ 2,5
Pja1O55176 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30,66■■■□□ 2,5
Pja1O55176 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
Pja1O55176 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30,56■■■□□ 2,48
Pja1O55176 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Pja1O55176 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Pja1O55176 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Pja1O55176 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30,41■■■□□ 2,46
Pja1O55176 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,4■■■□□ 2,46
Pja1O55176 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Pja1O55176 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Pja1O55176 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Pja1O55176 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Pja1O55176 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Pja1O55176 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Pja1O55176 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,43
Pja1O55176 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,18■■■□□ 2,42
Pja1O55176 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Pja1O55176 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Pja1O55176 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30,05■■■□□ 2,4
Pja1O55176 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Pja1O55176 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Pja1O55176 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,01■■■□□ 2,39
Pja1O55176 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Pja1O55176 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Pja1O55176 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Pja1O55176 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Pja1O55176 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Pja1O55176 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Pja1O55176 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29,65■■■□□ 2,34
Pja1O55176 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Pja1O55176 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Pja1O55176 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Pja1O55176 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Pja1O55176 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Pja1O55176 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29,49■■■□□ 2,31
Pja1O55176 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Pja1O55176 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,46■■■□□ 2,31
Pja1O55176 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Pja1O55176 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Pja1O55176 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Pja1O55176 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Pja1O55176 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Pja1O55176 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29,41■■■□□ 2,3
Pja1O55176 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Pja1O55176 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Pja1O55176 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29,32■■■□□ 2,28
Pja1O55176 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Pja1O55176 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29,24■■■□□ 2,27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17,1 ms