Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0T4

Itgad, Integrin alpha-D, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgadQ3V0T4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,75■■■■□ 3,47
ItgadQ3V0T4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,42■■■■□ 3,26
ItgadQ3V0T4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,24■■■■□ 3,23
ItgadQ3V0T4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,64■■■■□ 3,14
ItgadQ3V0T4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34,64■■■■□ 3,14
ItgadQ3V0T4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34,36■■■■□ 3,09
ItgadQ3V0T4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,11■■■■□ 3,05
ItgadQ3V0T4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,37■■■□□ 2,93
ItgadQ3V0T4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,28■■■□□ 2,92
ItgadQ3V0T4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,04■■■□□ 2,88
ItgadQ3V0T4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,88■■■□□ 2,85
ItgadQ3V0T4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,83■■■□□ 2,85
ItgadQ3V0T4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,7■■■□□ 2,83
ItgadQ3V0T4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,65■■■□□ 2,82
ItgadQ3V0T4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,8
ItgadQ3V0T4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
ItgadQ3V0T4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32,26■■■□□ 2,75
ItgadQ3V0T4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32,13■■■□□ 2,73
ItgadQ3V0T4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32,06■■■□□ 2,72
ItgadQ3V0T4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,84■■■□□ 2,69
ItgadQ3V0T4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,84■■■□□ 2,69
ItgadQ3V0T4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,6■■■□□ 2,65
ItgadQ3V0T4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,53■■■□□ 2,64
ItgadQ3V0T4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,49■■■□□ 2,63
ItgadQ3V0T4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31,44■■■□□ 2,62
ItgadQ3V0T4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31,33■■■□□ 2,61
ItgadQ3V0T4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31,23■■■□□ 2,59
ItgadQ3V0T4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31,22■■■□□ 2,59
ItgadQ3V0T4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
ItgadQ3V0T4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31,17■■■□□ 2,58
ItgadQ3V0T4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,14■■■□□ 2,58
ItgadQ3V0T4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
ItgadQ3V0T4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,07■■■□□ 2,56
ItgadQ3V0T4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
ItgadQ3V0T4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31■■■□□ 2,55
ItgadQ3V0T4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
ItgadQ3V0T4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30,98■■■□□ 2,55
ItgadQ3V0T4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30,93■■■□□ 2,54
ItgadQ3V0T4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30,93■■■□□ 2,54
ItgadQ3V0T4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
ItgadQ3V0T4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
ItgadQ3V0T4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
ItgadQ3V0T4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,85■■■□□ 2,53
ItgadQ3V0T4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
ItgadQ3V0T4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
ItgadQ3V0T4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,69■■■□□ 2,5
ItgadQ3V0T4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
ItgadQ3V0T4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
ItgadQ3V0T4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
ItgadQ3V0T4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30,43■■■□□ 2,46
ItgadQ3V0T4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
ItgadQ3V0T4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
ItgadQ3V0T4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
ItgadQ3V0T4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
ItgadQ3V0T4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,43
ItgadQ3V0T4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,11■■■□□ 2,41
ItgadQ3V0T4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
ItgadQ3V0T4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
ItgadQ3V0T4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,02■■■□□ 2,4
ItgadQ3V0T4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
ItgadQ3V0T4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
ItgadQ3V0T4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29,93■■■□□ 2,38
ItgadQ3V0T4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
ItgadQ3V0T4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
ItgadQ3V0T4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
ItgadQ3V0T4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
ItgadQ3V0T4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29,82■■■□□ 2,36
ItgadQ3V0T4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
ItgadQ3V0T4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
ItgadQ3V0T4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29,71■■■□□ 2,35
ItgadQ3V0T4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
ItgadQ3V0T4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
ItgadQ3V0T4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29,55■■■□□ 2,32
ItgadQ3V0T4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
ItgadQ3V0T4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
ItgadQ3V0T4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
ItgadQ3V0T4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
ItgadQ3V0T4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
ItgadQ3V0T4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
ItgadQ3V0T4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
ItgadQ3V0T4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
ItgadQ3V0T4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
ItgadQ3V0T4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
ItgadQ3V0T4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
ItgadQ3V0T4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29,24■■■□□ 2,27
ItgadQ3V0T4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
ItgadQ3V0T4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29,2■■■□□ 2,27
ItgadQ3V0T4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
ItgadQ3V0T4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,17■■■□□ 2,26
ItgadQ3V0T4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
ItgadQ3V0T4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
ItgadQ3V0T4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29,1■■■□□ 2,25
ItgadQ3V0T4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
ItgadQ3V0T4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29,08■■■□□ 2,25
ItgadQ3V0T4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,24
ItgadQ3V0T4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29,01■■■□□ 2,23
ItgadQ3V0T4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
ItgadQ3V0T4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
ItgadQ3V0T4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
ItgadQ3V0T4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34,4 ms