RNA–Protein interactions for RNA: YOR033C

EXO1, Transcript of 5'-3' exonuclease and flap-endonuclease, yeast

Gene EXO1, Length 2,109 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EXO1	YOR033C	ENT4	Q07872	247 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	YDR018C	Q12185	396 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	PHO2	P07269	559 aa		4.77	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	SPE1	P08432	466 aa		4.77	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	CDC34	P14682	295 aa		4.77	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	SAG1	P20840	650 aa		4.77	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	URK1	P27515	501 aa		4.77	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	ERG3	P32353	365 aa		4.77	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	APL3	P38065	1025 aa		4.77	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	TAT1	P38085	619 aa		4.77	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	FLR1	P38124	548 aa		4.77	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	YEL057C	P39983	233 aa		4.77	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	NPP2	P39997	493 aa		4.77	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	GET2	P40056	285 aa		4.77	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	LRO1	P40345	661 aa		4.77	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	YGR168C	P53293	376 aa		4.77	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	BOR1	P53838	576 aa		4.77	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	ASI3	P53983	676 aa		4.77	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	ROD1	Q02805	837 aa		4.77	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	AIM33	Q04516	312 aa		4.77	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	BSP1	Q06604	576 aa		4.77	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	IPK1	Q06667	281 aa		4.77	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	EAF3	Q12432	401 aa		4.77	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	KCS1	Q12494	1050 aa		4.77	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	SAL1	D6W196	494 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	QCR7	P00128	127 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	SNF5	P18480	905 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	RML2	P32611	393 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	KKQ8	P36004	724 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	RIM2	P38127	377 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	YBR071W	P38243	211 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	YHL041W	P38730	149 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	EAF5	P39995	279 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	YER188W	P40103	239 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	PEP8	P40335	379 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	TAD2	P47058	250 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	PMT3	P47190	753 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	CTR1	P49573	406 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	PHO23	P50947	330 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	ROG1	P53118	685 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	YGL114W	P53134	725 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	YNL140C	P53910	189 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	CYT2	Q00873	224 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	OAZ1	Q02803	292 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	ELC1	Q03071	99 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	YMR155W	Q03795	547 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	DAL4	Q04895	635 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	TMS1	Q12116	473 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	RGT2	Q12300	763 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	PST1	Q12355	444 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	ERD1	P16151	362 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	RER2	P35196	286 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	QDR3	P38227	689 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	DER1	P38307	211 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	YAR028W	P39548	234 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	SBH2	P52871	88 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	NPY1	P53164	384 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	DPP1	Q05521	289 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	CUR1	Q06469	252 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	CYC7	P00045	113 aa		4.75	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.75	□□□□□ -1.65	not detected
EXO1	YOR033C	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.75	□□□□□ -1.65	not detected
EXO1	YOR033C	CBP4	P37267	147 aa		4.75	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	AGP2	P38090	596 aa		4.75	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	YHL044W	P38727	235 aa		4.75	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	HEM14	P40012	539 aa		4.75	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	SYS1	P41544	203 aa		4.75	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	BAP3	P41815	604 aa		4.75	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	TOS3	P43637	560 aa		4.75	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	RPA43	P46669	326 aa		4.75	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	GOT1	Q03554	138 aa		4.75	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	HRD3	Q05787	833 aa		4.75	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	TCO89	Q08921	799 aa		4.75	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	RTN2	Q12443	393 aa		4.75	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	YOL163W	P0CF20	169 aa		4.75	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	SEC22	P22214	214 aa		4.75	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	YCR023C	P25351	611 aa		4.75	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 35.5 ms