RNA–Protein interactions for RNA: YNL228W

YNL228W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL228W, Length 777 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL228W	YNL228W	CSM4	Q08955	156 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	PHO2	P07269	559 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	ZRC1	P20107	442 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	CMK2	P22517	447 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	YKL187C	P34231	750 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	SOL2	P37262	315 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	SHE1	P38200	338 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	YBR062C	P38239	180 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	ATG12	P38316	186 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	YER184C	P39961	794 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	VAB2	P40003	282 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	GLG2	P47011	380 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	HOC1	P47124	396 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	YPS5	P53057	165 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	MAL13	P53338	473 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	YNR066C	P53752	436 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	BOR1	P53838	576 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	RNH201	P53942	307 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	YPR172W	Q06608	200 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	JIP3	O13555	125 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	RPO26	P20435	155 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	CDC50	P25656	391 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	AEP1	P32493	518 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	MIG3	P39943	394 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	STB1	P42845	420 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	VEL1	P53058	206 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	ADD37	Q03233	198 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	YML018C	Q03730	393 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	YOR376W	Q08900	122 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	STH1	P32597	1359 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	QRI5	P32344	111 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	GPX1	P36014	167 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	BMT2	P38278	337 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	SDS23	P53172	527 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	DCR2	Q05924	578 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	LIP2	Q06005	328 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	SEC10	Q06245	871 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	MMT2	Q08970	484 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	VIK1	Q12045	647 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	DAL81	P21657	970 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	RPC17	P47076	161 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	YNL095C	P53932	642 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	VPS60	Q03390	229 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	YDR115W	Q04598	105 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	YOR292C	Q08743	309 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	PEX3	P28795	441 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	RIB1	P38066	345 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	OM14	P38325	134 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	MIC12	P38341	106 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	DSN1	P40568	576 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	USE1	P53146	245 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	ZRG17	P53735	605 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	ASI3	P53983	676 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	MHR1	Q06630	226 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	YAL064W-B	O13512	126 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YNL228W	YNL228W	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YNL228W	YNL228W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YNL228W	YNL228W	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YNL228W	YNL228W	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YNL228W	YNL228W	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YNL228W	YNL228W	EFM1	P38732	585 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YNL228W	YNL228W	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YNL228W	YNL228W	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YNL228W	YNL228W	SER33	P40510	469 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YNL228W	YNL228W	MRX11	Q03079	207 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YNL228W	YNL228W	SEY1	Q99287	776 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YNL228W	YNL228W	STE18	P18852	110 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YNL228W	YNL228W	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YNL228W	YNL228W	GAB1	P41733	394 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YNL228W	YNL228W	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YNL228W	YNL228W	IGD1	P43598	195 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YNL228W	YNL228W	YJR079W	P47126	109 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YNL228W	YNL228W	COG7	P53195	279 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YNL228W	YNL228W	SWS2	P53937	143 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YNL228W	YNL228W	RMI1	Q02685	241 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YNL228W	YNL228W	GET4	Q12125	312 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YNL228W	YNL228W	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YNL228W	YNL228W	NCB2	Q92317	146 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YNL228W	YNL228W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
YNL228W	YNL228W	JEN1	P36035	616 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YNL228W	YNL228W	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 46 ms