RNA–Protein interactions for RNA: YMR188C

MRPS17, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene MRPS17, Length 714 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRPS17	YMR188C	YOR114W	Q12219	294 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MRPS17	YMR188C	RAD3	P06839	778 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MRPS17	YMR188C	POF1	P25576	258 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MRPS17	YMR188C	CWP1	P28319	239 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MRPS17	YMR188C	SUA5	P32579	426 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MRPS17	YMR188C	FRM2	P37261	193 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MRPS17	YMR188C	YIL054W	P40524	105 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MRPS17	YMR188C	COG7	P53195	279 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MRPS17	YMR188C	TAF9	Q05027	157 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MRPS17	YMR188C	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
MRPS17	YMR188C	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
MRPS17	YMR188C	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	MSF1	P08425	469 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	DAL81	P21657	970 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	AEP1	P32493	518 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	KRE29	P40026	464 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	YFL012W	P43580	148 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	ARV1	Q06541	321 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	CDC42	P19073	191 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	RRT12	P25381	491 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	AIM29	P36154	155 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	MRPS9	P38120	278 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	MRP21	P38175	177 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	ATG12	P38316	186 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	BIG1	P38813	335 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	SEN34	P39707	275 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	SEO1	P39709	593 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	DDI1	P40087	428 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	TPN1	P53099	579 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	CDC14	Q00684	551 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	YDR209C	Q03480	137 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	YML018C	Q03730	393 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	YOR029W	Q12243	111 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	TRM10	Q12400	293 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	YCR025C	P25352	136 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	ZIP1	P31111	875 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	MRPL3	P36516	390 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	RRG9	P40156	214 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	AVT7	P40501	490 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	YAR1	P46683	200 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	YJR012C	P47087	207 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	COQ5	P49017	307 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	TIM21	P53220	239 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	CAX4	P53223	239 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	APJ1	P53940	528 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	MRS2	Q01926	470 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	PET117	Q02771	107 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	YPL113C	Q02961	396 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	VPS60	Q03390	229 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	CFT1	Q06632	1357 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	AUS1	Q08409	1394 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	MBA1	P38300	278 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	SHC1	P39000	512 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	EDC2	P40023	145 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	YFL064C	P43540	174 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	MIC19	P43594	170 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	IBA57	P47158	497 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	MRX8	Q05473	314 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	SEC10	Q06245	871 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	YDL211C	Q12121	372 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	YOL085C	Q99345	113 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	IME2	P32581	645 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.04	□□□□□ -1.92	not detected
MRPS17	YMR188C	FRT2	P39734	528 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	UFE1	P41834	346 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	ASG7	P46993	209 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	MRPL50	P53724	139 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	MNT4	P53745	580 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	RNH1	Q04740	348 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	ECM19	Q06011	112 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	YAL064W-B	O13512	126 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	COX10	P21592	462 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	MSN4	P33749	630 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	MID2	P36027	376 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	BDH1	P39714	382 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	ECM11	Q04110	302 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	PAM18	Q07914	168 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	YOS9	Q99220	542 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MRPS17	YMR188C	RPB9	P27999	122 aa		3.02	□□□□□ -1.93
MRPS17	YMR188C	PEX3	P28795	441 aa		3.02	□□□□□ -1.93

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