RNA–Protein interactions for RNA: YKL163W

PIR3, Transcript of O-glycosylated covalently-bound cell wall protein, yeastyeast

Gene PIR3, Length 978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PIR3YKL163W YNL194CP40169 301 aa3.69□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W PHB2P50085 310 aa3.69□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W CWC23P52868 283 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W CAF40P53829 373 aa3.69□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W TDA7P53882 636 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W MRS2Q01926 470 aa3.69□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W NNT1Q05874 261 aa3.69□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W YET3Q07451 203 aa3.69□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W SNA4Q07549 140 aa3.69□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W YDL218WQ07629 317 aa3.69□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W APC9Q12107 265 aa3.69□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W ORT1Q12375 292 aa3.69□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W YKL183C-AQ3E765 70 aa3.69□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W YAR066WP0CX18 203 aa3.68□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W YHR214WP0CX19 203 aa3.68□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W YMC1P32331 307 aa3.68□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W MKK1P32490 508 aa3.68□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W CUE1P38428 203 aa3.68□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W ARN1P38731 627 aa3.68□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W CCT4P39078 528 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W NPT1P39683 429 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W FRT2P39734 528 aa3.68□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W PRE6P40303 254 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W YIA6P40556 373 aa3.68□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W KEG1P43614 200 aa3.68□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W HOC1P47124 396 aa3.68□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W NOP19P53317 196 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W FRE4P53746 719 aa3.68□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W CAC2Q04199 468 aa3.68□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W PEX12Q04370 399 aa3.68□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W PEX10Q05568 337 aa3.68□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W POM33Q12164 279 aa3.68□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W RGT2Q12300 763 aa3.68□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W NCA2Q12374 616 aa3.68□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W FAR1P21268 830 aa3.67□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W MAK32P23060 363 aa3.67□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W VPH2P32341 215 aa3.67□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W TOA2P32774 122 aa3.67□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W DTR1P38125 572 aa3.67□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W AME1P38313 324 aa3.67□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W WSC4P38739 605 aa3.67□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W IKI1P38874 309 aa3.67□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W VRG4P40107 337 aa3.67□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W SLM1P40485 686 aa3.67□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W UFE1P41834 346 aa3.67□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W GUF1P46943 645 aa3.67□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W YJL043WP47053 257 aa3.67□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W YJR054WP47114 497 aa3.67□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W VEL1P53058 206 aa3.67□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W FLC3P53121 802 aa3.67□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W HCH1P53834 153 aa3.67□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W CTL1Q03220 320 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W PLB3Q08108 686 aa3.67□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W SRL2Q12020 392 aa3.67□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W TPT1Q12272 230 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W QCR7P00128 127 aa3.66□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W PAB1P04147 577 aaKnown RBP RIP-Chip data3.66□□□□□ -1.82not detected
PIR3YKL163W DEP1P31385 405 aa3.66□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W MRPL6P32904 214 aa3.66□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W ATO2P32907 282 aa3.66□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W LOS1P33418 1100 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W TAF14P35189 244 aa3.66□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W YCR041WP37265 110 aa3.66□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W FIG1P38224 298 aa3.66□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W RCK2P38623 610 aa3.66□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W URA8P38627 578 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W GEP4P38812 185 aa3.66□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W SRP14P38985 146 aa3.66□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W SOP4P39543 234 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W ERV46P39727 415 aa3.66□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W RPH1P39956 796 aa3.66□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W TIF34P40217 347 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W POG1P40473 351 aa3.66□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W RSM25P40496 264 aa3.66□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W ASG7P46993 209 aa3.66□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W LSM1P47017 172 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W YJR012CP47087 207 aa3.66□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W NBP1P52919 319 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W RRN9P53437 365 aa3.66□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W YNR048WP53740 393 aa3.66□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W MTQ1P53944 314 aa3.66□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W CTF19Q02732 369 aa3.66□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W MZM1Q03429 123 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W VBA1Q04301 562 aa3.66□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W CTR3Q06686 241 aa3.66□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W MUM3Q08750 479 aa3.66□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W DDC1Q08949 612 aa3.66□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W RRP42Q12277 265 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W RKM5Q12367 367 aa3.66□□□□□ -1.82
PIR3YKL163W TEF1P02994 458 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W RPL31AP0C2H8 113 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W YCR100CP25606 316 aa3.65□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W YEF1P32622 495 aa3.65□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W SGE1P33335 543 aa3.65□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W SPO23P33757 523 aa3.65□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W SRP102P36057 244 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W APD1P38281 316 aa3.65□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W YHK8P38776 514 aa3.65□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W GAT1P43574 510 aa3.65□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W YJR149WP47177 404 aa3.65□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.1 ms