RNA–Protein interactions for RNA: YHR085W

IPI1, Transcript of Component of the Rix1 complex and possibly pre-replicative complexes, yeast

Gene IPI1, Length 1,005 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
IPI1	YHR085W	YGR067C	P53243	804 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	GPI1	P53306	609 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	OCA2	P53949	197 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	YDR541C	Q03049	344 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	ARP10	Q04549	284 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	SPC2	Q04969	178 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	RAX1	Q08760	435 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	TIM9	O74700	87 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	YAK1	P14680	807 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	CMK2	P22517	447 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	GRR1	P24814	1151 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	LDB16	P25587	256 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	ATP7	P30902	174 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	RIB7	P33312	244 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	LAG1	P38703	411 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	TRR2	P38816	342 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	MTQ1	P53944	314 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	GMC2	Q06201	188 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	SCEI	P03882	235 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	PPQ1	P32945	549 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	AST1	P35183	429 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	YBR241C	P38142	488 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	PAC2	P39937	518 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	YIL060W	P40519	144 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	RSM10	Q03201	203 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	MDM30	Q05930	598 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	SPO77	Q06134	477 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	YPR091C	Q06833	770 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	RDR1	Q08904	546 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	CPR3	P25719	182 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	SNC1	P31109	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	NTG1	P31378	399 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	HSP150	P32478	413 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	OM14	P38325	134 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	VPS52	P39904	641 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	CUP9	P41817	306 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	YFR054C	P43622	192 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	RMR1	P53060	241 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	YIP5	P53108	310 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	SEI1	Q06058	285 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	TPO3	Q06451	622 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	FDH1	Q08911	376 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	YOR342C	Q12182	319 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	YDL199C	Q12407	687 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	YCR100C	P25606	316 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	PEX3	P28795	441 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
IPI1	YHR085W	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	AGP3	P43548	558 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	IRC7	P43623	340 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	YNL181W	P53878	407 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	YNL095C	P53932	642 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	NCE101	Q02820	53 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	PEX12	Q04370	399 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	NAT4	Q04751	285 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	RNH202	Q05635	350 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	YPR172W	Q06608	200 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	IPK1	Q06667	281 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
IPI1	YHR085W	RRT8	Q08219	342 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	AKR2	Q12013	749 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	YDL211C	Q12121	372 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	TPO4	Q12256	659 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	MHF2	Q3E829	80 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	SNF4	P12904	322 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	NAM9	P27929	486 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	ECM25	P32525	599 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	ECM34	P38728	170 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	ALP1	P38971	573 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	PHO90	P39535	881 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	RBG1	P39729	369 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	SYG1	P40528	902 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	HXT9	P40885	567 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	PHB1	P40961	287 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	BLM10	P43583	2143 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	HMS2	P47175	358 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	RSC9	Q03124	581 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63

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