RNA–Protein interactions for RNA: YGR035C

YGR035C, Transcript of Putative protein of unknown function, potential Cdc28p substrate, yeast

Gene YGR035C, Length 351 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YGR035C	YGR035C	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	0.61	□□□□□ -2.31
YGR035C	YGR035C	DOA4	P32571	926 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YGR035C	YGR035C	YHL026C	P38740	315 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YGR035C	YGR035C	YHR035W	P38769	630 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YGR035C	YGR035C	AVT7	P40501	490 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YGR035C	YGR035C	YGL114W	P53134	725 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YGR035C	YGR035C	ISD11	Q6Q560	94 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YGR035C	YGR035C	ZRT1	P32804	376 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YGR035C	YGR035C	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
YGR035C	YGR035C	YPC1	P38298	316 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YGR035C	YGR035C	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
YGR035C	YGR035C	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YGR035C	YGR035C	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YGR035C	YGR035C	ATG15	P25641	520 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YGR035C	YGR035C	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	0.59	□□□□□ -2.31
YGR035C	YGR035C	DAD2	P36162	133 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YGR035C	YGR035C	GON7	P46984	123 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YGR035C	YGR035C	YGR168C	P53293	376 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YGR035C	YGR035C	YOL019W	Q08157	551 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YGR035C	YGR035C	YDR262W	Q12331	272 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YGR035C	YGR035C	RAD7	P06779	565 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YGR035C	YGR035C	RSC1	P53236	928 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YGR035C	YGR035C	YPL039W	Q03080	316 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YGR035C	YGR035C	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	0.58	□□□□□ -2.32
YGR035C	YGR035C	KRE6	P32486	720 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YGR035C	YGR035C	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
YGR035C	YGR035C	COT1	P32798	439 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YGR035C	YGR035C	PHO89	P38361	574 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YGR035C	YGR035C	YJL118W	P47022	219 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YGR035C	YGR035C	NUP57	P48837	541 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YGR035C	YGR035C	UBC13	P52490	153 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YGR035C	YGR035C	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
YGR035C	YGR035C	STE23	Q06010	1027 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YGR035C	YGR035C	SKS1	Q12505	502 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YGR035C	YGR035C	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YGR035C	YGR035C	CDC7	P06243	507 aa		0.56	□□□□□ -2.32
YGR035C	YGR035C	SGA1	P08019	549 aa		0.56	□□□□□ -2.32
YGR035C	YGR035C	YOL162W	P0CF19	215 aa		0.56	□□□□□ -2.32
YGR035C	YGR035C	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
YGR035C	YGR035C	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
YGR035C	YGR035C	CAJ1	P39101	391 aa		0.56	□□□□□ -2.32
YGR035C	YGR035C	SEN34	P39707	275 aa		0.56	□□□□□ -2.32
YGR035C	YGR035C	EOS1	P53938	366 aa		0.56	□□□□□ -2.32
YGR035C	YGR035C	ECM18	Q04623	453 aa		0.56	□□□□□ -2.32
YGR035C	YGR035C	FRE6	Q12473	712 aa		0.56	□□□□□ -2.32
YGR035C	YGR035C	ERG2	P32352	222 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YGR035C	YGR035C	POP8	P38208	133 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YGR035C	YGR035C	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	0.55	□□□□□ -2.32
YGR035C	YGR035C	COG7	P53195	279 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YGR035C	YGR035C	UBR2	Q07963	1872 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YGR035C	YGR035C	AEP1	P32493	518 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YGR035C	YGR035C	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
YGR035C	YGR035C	YKL162C	P36052	402 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YGR035C	YGR035C	DSE2	P38844	325 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YGR035C	YGR035C	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
YGR035C	YGR035C	PEP8	P40335	379 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YGR035C	YGR035C	OKP1	P53298	406 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YGR035C	YGR035C	TAZ1	Q06510	381 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YGR035C	YGR035C	PUT1	P09368	476 aa		0.53	□□□□□ -2.32
YGR035C	YGR035C	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
YGR035C	YGR035C	YKR045C	P36138	183 aa		0.53	□□□□□ -2.32
YGR035C	YGR035C	SPT8	P38915	602 aa		0.53	□□□□□ -2.32
YGR035C	YGR035C	YER135C	P40082	130 aa		0.53	□□□□□ -2.32
YGR035C	YGR035C	JEM1	P40358	645 aa		0.53	□□□□□ -2.32
YGR035C	YGR035C	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
YGR035C	YGR035C	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
YGR035C	YGR035C	SWC4	P53201	476 aa		0.53	□□□□□ -2.32
YGR035C	YGR035C	NUP49	Q02199	472 aa		0.53	□□□□□ -2.32
YGR035C	YGR035C	CAB5	Q03941	241 aa		0.53	□□□□□ -2.32
YGR035C	YGR035C	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
YGR035C	YGR035C	SCM4	P32564	187 aa		0.52	□□□□□ -2.33
YGR035C	YGR035C	INA22	P40576	216 aa		0.52	□□□□□ -2.33
YGR035C	YGR035C	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	0.52	□□□□□ -2.33
YGR035C	YGR035C	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	0.52	□□□□□ -2.33
YGR035C	YGR035C	IZH4	Q99393	312 aa		0.52	□□□□□ -2.33
YGR035C	YGR035C	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	0.51	□□□□□ -2.33
YGR035C	YGR035C	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	0.51	□□□□□ -2.33
YGR035C	YGR035C	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	0.51	□□□□□ -2.33
YGR035C	YGR035C	SFC1	P33303	322 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YGR035C	YGR035C	CSG2	P35206	410 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YGR035C	YGR035C	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.51	□□□□□ -2.33	not detected
YGR035C	YGR035C	RXT2	P38255	430 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YGR035C	YGR035C	ARN2	P38724	620 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YGR035C	YGR035C	GDS1	P41913	522 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YGR035C	YGR035C	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	0.51	□□□□□ -2.33
YGR035C	YGR035C	SNX4	P47057	423 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YGR035C	YGR035C	TAD2	P47058	250 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YGR035C	YGR035C	YML018C	Q03730	393 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YGR035C	YGR035C	PEX12	Q04370	399 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YGR035C	YGR035C	DPP1	Q05521	289 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YGR035C	YGR035C	YPR064W	Q12492	139 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YGR035C	YGR035C	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
YGR035C	YGR035C	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	0.49	□□□□□ -2.33
YGR035C	YGR035C	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
YGR035C	YGR035C	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
YGR035C	YGR035C	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	0.49	□□□□□ -2.33
YGR035C	YGR035C	GLE2	P40066	365 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YGR035C	YGR035C	CIS3	P47001	227 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YGR035C	YGR035C	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
YGR035C	YGR035C	YOR114W	Q12219	294 aa		0.49	□□□□□ -2.33

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