RNA–Protein interactions for RNA: YCL057W

PRD1, Transcript of Zinc metalloendopeptidase, yeast

Gene PRD1, Length 2,139 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PRD1	YCL057W	JAC1	P53193	184 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	MKC7	P53379	596 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	CAF40	P53829	373 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	SPP2	Q02521	185 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	SNZ1	Q03148	297 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	VPS74	Q06385	345 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	FEX2	Q08991	375 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	SIA1	Q12212	622 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	SPT3	P06844	337 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	MSF1	P08425	469 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	MAS1	P10507	462 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	UNG1	P12887	359 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.26	□□□□□ -1.73	not detected
PRD1	YCL057W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	SSO1	P32867	290 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	MRPL3	P36516	390 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	BNA6	P43619	295 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.26	□□□□□ -1.73	not detected
PRD1	YCL057W	ECM11	Q04110	302 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	AIM32	Q04689	311 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	MDM30	Q05930	598 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	VAM3	Q12241	283 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	DSF1	P0CX08	502 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	YNR073C	P0CX09	502 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	YCR022C	P25620	114 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	SEC17	P32602	292 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	YBR056W	P38081	501 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	RCK1	P38622	512 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	RRG9	P40156	214 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	ALG8	P40351	577 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	ZIM17	P42844	174 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	HMS2	P47175	358 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	TOM22	P49334	152 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	SHY1	P53266	389 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	GRX8	Q05926	109 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	RBK1	P25332	333 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	MBA1	P38300	278 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	HPA3	P39979	161 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	ATG18	P43601	500 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	ECM27	P47144	725 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	LDB18	Q07887	179 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	DAP1	Q12091	152 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	DCC1	P25559	380 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	YCR102C	P25608	368 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	RSM22	P36056	628 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	CBP4	P37267	147 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	YER184C	P39961	794 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	PAN6	P40459	309 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	SNM1	P40993	198 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	YDR249C	Q03787	373 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	RNH1	Q04740	348 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	PET54	P10834	293 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	REC114	P32841	428 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	DRE2	P36152	348 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	BIG1	P38813	335 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	SBE22	P38814	852 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	MDM31	P38880	579 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	NVJ1	P38881	321 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	FET3	P38993	636 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	PMT4	P46971	762 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	GWT1	P47026	490 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	GPI8	P49018	411 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	RRN9	P53437	365 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	AIM36	Q03798	255 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	ARV1	Q06541	321 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	PLB3	Q08108	686 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	RRT8	Q08219	342 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	SPS2	P08459	502 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	CNB1	P25296	175 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	PTR2	P32901	601 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	TKL2	P33315	681 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	LDB7	P38210	180 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	SAS2	P40963	338 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	YFR018C	P43599	363 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	APS3	P47064	194 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	ERV29	P53337	310 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	IGO1	P53897	168 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	MRPS16	Q02608	121 aa		4.23	□□□□□ -1.73

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