RNA–Protein interactions for RNA: RDN25-2

RDN25-2, Transcript of 25S ribosomal RNA (25S rRNA), yeastyeast

Gene RDN25-2, Length 3,396 nt, Biotype rRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDN25-2RDN25-2 YMR087WQ04299 284 aa8.9□□□□□ -0.98
RDN25-2RDN25-2 YLR225CQ05948 407 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
RDN25-2RDN25-2 YPR114WQ06107 315 aa8.9□□□□□ -0.98
RDN25-2RDN25-2 MRL1Q06815 381 aa8.9□□□□□ -0.98
RDN25-2RDN25-2 ISC1P40015 477 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 AVT4P50944 713 aa8.9□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 MPA43P53583 542 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 YDR366CP87287 132 aa8.9□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 PLB2Q03674 706 aa8.9□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 YML083CQ04526 418 aa8.9□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 FDH1Q08911 376 aa8.9□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 SSN3P39073 555 aa8.89□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 SLS1P42900 643 aa8.89□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 ADO1P47143 340 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 TPO3Q06451 622 aa8.89□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 RRT8Q08219 342 aa8.89□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 TMS1Q12116 473 aa8.89□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 MRX4Q12467 430 aa8.89□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 MEX67Q99257 599 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 SNF6P18888 332 aa8.89□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 SUA5P32579 426 aa8.89□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 SNC2P33328 115 aa8.89□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 RAS1P01119 309 aa8.89□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 DTR1P38125 572 aa8.89□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 BDH1P39714 382 aa8.89□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 PRM10P42946 383 aa8.89□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 YAE1P47118 141 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 YSA1Q01976 231 aa8.89□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 CCE1Q03702 353 aa8.89□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 RIM13Q03792 727 aa8.89□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 SHH3Q04487 196 aa8.89□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 CRT10Q08226 957 aa8.89□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 YPQ1Q12010 308 aa8.89□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 CDC50P25656 391 aa8.88□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 TIP1P27654 210 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 TCD2P36101 447 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 ZTA1P38230 334 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 BUD17P53727 317 aa8.88□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 TIR4Q12218 487 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 HTS1P07263 546 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 ZRC1P20107 442 aa8.88□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 LAC1P28496 418 aa8.88□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 ASC1P38011 319 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 YAR1P46683 200 aa8.88□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 PRY3P47033 881 aa8.88□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 MDM34P53083 459 aa8.88□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 YDC1Q02896 317 aa8.88□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 MSS11Q03825 758 aa8.88□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 PRE1P22141 198 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 SGE1P33335 543 aa8.87□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 RTC2P38279 296 aa8.87□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 IGO1P53897 168 aa8.87□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 ANT1Q06497 328 aa8.87□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 RTN2Q12443 393 aa8.87□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 CKA1P15790 372 aa8.87□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 YBR220CP38318 560 aa8.87□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 SKO1Q02100 647 aa8.87□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 CTK1Q03957 528 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 PUN1Q06991 263 aa8.87□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 TGS1Q12052 315 aa8.87□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 ARE1P25628 610 aa8.87□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 SNM1P40993 198 aa8.87□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 AIM25P47140 327 aa8.87□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 SGF73P53165 657 aa8.87□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 YGR079WP53249 370 aa8.87□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 SDH4P37298 181 aa8.86□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 PUS4P48567 403 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 KXD1P53158 218 aa8.86□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 YGR015CP53208 328 aa8.86□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 MEP3P53390 489 aa8.86□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 YDR524C-BQ3E6R4 66 aa8.86□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 SPO7P18410 259 aa8.86□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 POT1P27796 417 aaKnown RBP RIP-Chip data8.86□□□□□ -0.99not detected
RDN25-2RDN25-2 HTD2P38790 280 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 YHR177WP38867 453 aa8.86□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 YPL272CQ08984 517 aa8.86□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 TFC7Q12415 435 aa8.86□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 COX2P00410 251 aa8.86□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 YIL108WP40483 696 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 SDT1P53078 280 aa8.86□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 TEN1Q07921 160 aa8.86□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 LEU9Q12166 604 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 AIM45Q12480 344 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 YLR099W-AQ3E798 87 aa8.86□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 GCV3P39726 170 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 BUD9P53226 547 aa8.85□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 RPL34AP87262 121 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 MAP1Q01662 387 aaKnown RBP RIP-Chip data8.85□□□□□ -0.99not detected
RDN25-2RDN25-2 YMR130WQ04223 302 aa8.85□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 TVP18Q04767 167 aa8.85□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 PRE3P38624 215 aa8.85□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 YIL165CP40446 119 aa8.85□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 MET28P40573 187 aa8.85□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 INP53Q12271 1107 aa8.85□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 MKK1P32490 508 aa8.84□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 SFC1P33303 322 aa8.84□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 BNA4P38169 460 aa8.84□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 SHE1P38200 338 aa8.84□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 STS1P38637 319 aa8.84□□□□□ -0.99
RDN25-2RDN25-2 YHR210CP38893 341 aa8.84□□□□□ -0.99
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