RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	SLITRK3	O94933	977 aa		7.86	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	ATP4A	P20648	1035 aa		7.86	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	CA8	P35219	290 aa		7.86	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	7.86	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	CCT5	P48643	541 aa		7.86	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	OSTN	P61366	133 aa		7.86	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	FAAP100	Q0VG06	881 aa		7.86	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	LAMB3	Q13751	1172 aa		7.86	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	ARID5B	Q14865	1188 aa		7.86	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		7.86	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		7.86	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		7.86	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	ANO5	Q75V66	913 aa		7.86	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	7.86	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		7.86	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		7.86	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	HPS3	Q969F9	1004 aa		7.86	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM20A	Q96MK3	541 aa		7.86	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		7.86	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		7.86	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	RMI1	Q9H9A7	625 aa		7.86	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		7.86	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	L1RE1	Q9UN81	338 aa		7.86	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		7.86	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	NID2	Q14112	1375 aa		7.86	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495		A6NNZ2	444 aa		7.86	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495		M0QZ92	97 aa		7.86	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	F2	P00734	622 aa		7.86	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	OAT	P04181	439 aa		7.86	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	7.86	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	CYP3A4	P08684	503 aa		7.86	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	MYB	P10242	640 aa		7.86	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	CIITA	P33076	1130 aa		7.86	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	PSMC5	P62195	406 aa		7.86	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	IQCB1	Q15051	598 aa		7.86	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		7.86	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		7.86	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	7.86	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC5A5	Q92911	643 aa		7.86	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	CALML4	Q96GE6	196 aa		7.86	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	TCHP	Q9BT92	498 aa		7.86	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		7.86	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		7.86	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		7.86	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		7.86	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		7.86	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		7.86	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	VAV3	Q9UKW4	847 aa		7.86	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		7.86	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	PYGL	P06737	847 aa		7.85	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	PLCG1	P19174	1290 aa		7.85	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	STAT6	P42226	847 aa		7.85	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	7.85	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	7.85	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	7.85	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	SNX1	Q13596	522 aa		7.85	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	SLMAP	Q14BN4	828 aa		7.85	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	SNCB	Q16143	134 aa		7.85	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495		Q4G0T1	1027 aa		7.85	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	7.85	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		7.85	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	7.85	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	RNF149	Q8NC42	400 aa		7.85	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		7.85	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	RIT2	Q99578	217 aa		7.85	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		7.85	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	7.85	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	DNM3	Q9UQ16	869 aa		7.85	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		7.85	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		7.85	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	BIN1	O00499	593 aa		7.85	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	RSPH10B	P0C881	870 aa		7.85	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	7.85	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	ICAM3	P32942	547 aa		7.85	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		7.85	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		7.85	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	7.85	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		7.85	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	FSIP1	Q8NA03	581 aa		7.85	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		7.85	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	MORC4	Q8TE76	937 aa		7.85	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	7.85	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		7.85	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	CFAP45	Q9UL16	551 aa		7.85	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		7.85	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		7.85	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A087WZ62	844 aa		7.85	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	MYO1F	O00160	1098 aa		7.85	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	ZMYND10	O75800	440 aa		7.85	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	RASSF9	O75901	435 aa		7.85	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	CD52	P31358	61 aa		7.85	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	JAK3	P52333	1124 aa		7.85	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	MYBPC2	Q14324	1141 aa		7.85	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		7.85	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		7.85	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		7.85	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		7.85	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		7.85	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		7.85	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	7.85	□□□□□ -1.15

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