RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583444.1

SLC16A3-218, Transcript of solute carrier family 16 member 3, humanhuman

Gene SLC16A3, Length 2,882 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC16A3-218ENST00000583444 AGBL2Q5U5Z8 902 aa20.64■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 IL31RAQ8NI17 732 aa20.64■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 ADAM7Q9H2U9 754 aa20.64■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 HAUS2Q9NVX0 235 aa20.64■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 ARHGEF35A5YM69 484 aa20.63■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 CYP26A1O43174 497 aa20.63■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 POLR2MP0CAP2 368 aa20.63■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 PTGIRP43119 386 aa20.63■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa20.63■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 CCDC114Q96M63 670 aa20.63■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 CCDC113Q9H0I3 377 aa20.63■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 RAB17Q9H0T7 212 aa20.63■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 ITGB5P18084 799 aa20.63■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 ANXA13P27216 316 aa20.63■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 EPC2Q52LR7 807 aa20.63■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 C2CD6Q53TS8 623 aa20.63■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 PADI6Q6TGC4 694 aa20.63■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 MIGA2Q7L4E1 593 aa20.63■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 TATDN2Q93075 761 aa20.63■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 TLCD1Q96CP7 247 aa20.63■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 NACC1Q96RE7 527 aa20.63■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 MKNK1Q9BUB5 465 aa20.63■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 WDR11Q9BZH6 1224 aa20.63■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 SLC40A1Q9NP59 571 aa20.63■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 GGT7Q9UJ14 662 aa20.63■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 PIK3CDO00329 1044 aa20.62■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 RAD17O75943 681 aa20.62■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 KIF22Q14807 665 aa20.62■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 KIFC3Q9BVG8 833 aa20.62■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP20.62■□□□□ 0.899e-20■□□□□ 8.7
SLC16A3-218ENST00000583444 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa20.62■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 DRD4P21917 467 aa20.62■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 GSCP56915 257 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 BTNL9Q6UXG8 535 aa20.62■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 PPM1KQ8N3J5 372 aa20.62■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 CCDC127Q96BQ5 260 aa20.62■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 MMEP08473 750 aa20.61■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 CREB1P16220 341 aa20.61■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 CHRNB2P17787 502 aa20.61■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 DGKZQ13574 1117 aa20.61■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 OTUD6AQ7L8S5 288 aa20.61■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 NEK9Q8TD19 979 aa20.61■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 COL20A1Q9P218 1284 aa20.61■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 COL4A5P29400 1685 aa20.61■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa20.61■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 LLGL2Q6P1M3 1020 aa20.61■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa20.61■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 TTLL6Q8N841 843 aa20.61■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 AGBL1Q96MI9 1066 aa20.61■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 GMLQ99445 158 aa20.61■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 TRIM7Q9C029 511 aa20.61■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 CXorf56Q9H5V9 222 aa20.61■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 MLXIPLQ9NP71 852 aa20.61■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 KLC4Q9NSK0 619 aa20.61■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 VAMP7P51809 220 aa20.6■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 SPP2Q13103 211 aa20.6■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 DENND2CQ68D51 928 aa20.6■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 SAAL1Q96ER3 474 aa20.6■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 KREMEN1Q96MU8 473 aa20.6■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 ZSWIM1Q9BR11 485 aa20.6■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 TMOD2Q9NZR1 351 aa20.6■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 PEX5P50542 639 aa20.6■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 SNX1Q13596 522 aa20.6■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 LRRC14Q15048 493 aa20.6■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 ERMARDQ5T6L9 678 aa20.6■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 SEMA4DQ92854 862 aa20.6■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 TRPC6Q9Y210 931 aa20.6■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 ADRB2P07550 413 aa20.6■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 VIL1P09327 827 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 SOX10P56693 466 aa20.6■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 PPP2R5AQ15172 486 aa20.6■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 EPS8L1Q8TE68 723 aa20.6■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 PWWP2AQ96N64 755 aa20.6■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 STRA6Q9BX79 667 aa20.6■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa20.6■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 SLC16A4O15374 487 aa20.59■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 RASSF9O75901 435 aa20.59■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms