RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 KSR1Q8IVT5 923 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 RIT2Q99578 217 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 SH2D3AQ9BRG2 576 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 RTKNQ9BST9 563 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 PRKD2Q9BZL6 878 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 ZMYND12Q9H0C1 365 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 UNC45AQ9H3U1 944 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 USP18Q9UMW8 372 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 EPG5Q9HCE0 2579 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 ESYT2A0FGR8 921 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 DCDC2BA2VCK2 349 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM150BA6NC51 233 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 FAM170BA6NMN3 283 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 DDX11L8A8MPP1 907 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 ADAMTS3O15072 1205 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 TGM5O43548 720 aa10.22□□□□□ -0.77
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PTPRM-210ENST00000578916 NR1I2O75469 434 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 C1RP00736 705 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 ITGA4P13612 1032 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 FSHRP23945 695 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 GNA11P29992 359 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 DSG1Q02413 1049 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 PRKCQQ04759 706 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 SLC44A4Q53GD3 710 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 COLGALT2Q8IYK4 626 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 CNNM3Q8NE01 707 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 RDM1Q8NG50 284 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 LENG9Q96B70 501 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 CCDC136Q96JN2 1154 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 CEP89Q96ST8 783 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 UBN1Q9NPG3 1134 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP10.22□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 ZSCAN32Q9NX65 697 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 BRPF3Q9ULD4 1205 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 PAPLNO95428 1278 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 NCLP19338 710 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 MAGEA9P43362 315 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 NECTIN1Q15223 517 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 UBXN11Q5T124 520 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 PARM1Q6UWI2 310 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 MTSS1LQ765P7 747 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 GLYCTKQ8IVS8 523 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 BICD2Q8TD16 824 aa10.21□□□□□ -0.77
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PTPRM-210ENST00000578916 FGF14Q92915 247 aa10.21□□□□□ -0.77
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PTPRM-210ENST00000578916 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 COLEC11Q9BWP8 271 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 OSBPL6Q9BZF3 934 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 IFT122Q9HBG6 1241 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 CHST7Q9NS84 486 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 GMEB2Q9UKD1 530 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 CDH7Q9ULB5 785 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRM-210ENST00000578916 C2orf16Q68DN1 1984 aa10.21□□□□□ -0.78
PTPRM-210ENST00000578916 CEP250Q9BV73 2442 aa10.21□□□□□ -0.78
PTPRM-210ENST00000578916 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
PTPRM-210ENST00000578916 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRM-210ENST00000578916 NCAM2O15394 837 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRM-210ENST00000578916 TBC1D4O60343 1298 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRM-210ENST00000578916 ZMYND10O75800 440 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRM-210ENST00000578916 STBD1O95210 358 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRM-210ENST00000578916 EFEMP2O95967 443 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRM-210ENST00000578916 ADRB1P08588 477 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRM-210ENST00000578916 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRM-210ENST00000578916 CDC27P30260 824 aa10.2□□□□□ -0.78
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PTPRM-210ENST00000578916 ADD1P35611 737 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
PTPRM-210ENST00000578916 USP11P51784 963 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRM-210ENST00000578916 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
PTPRM-210ENST00000578916 PFKPQ01813 784 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRM-210ENST00000578916 CREMQ03060 361 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRM-210ENST00000578916 USP41Q3LFD5 358 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRM-210ENST00000578916 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRM-210ENST00000578916 RNF20Q5VTR2 975 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRM-210ENST00000578916 LILRA6Q6PI73 481 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRM-210ENST00000578916 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
PTPRM-210ENST00000578916 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
PTPRM-210ENST00000578916 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
PTPRM-210ENST00000578916 GPR65Q8IYL9 337 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRM-210ENST00000578916 ZBTB44Q8NCP5 570 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRM-210ENST00000578916 GJA10Q969M2 543 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRM-210ENST00000578916 B3GALT6Q96L58 329 aa10.2□□□□□ -0.78
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