RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 PDZD7Q9H5P4 517 aa36.38■■■■□ 3.41
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CASP5P51878 434 aa36.32■■■■□ 3.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa36.32■■■■□ 3.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 EEF1DP3Q658K8 133 aa36.32■■■■□ 3.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP36.32■■■■□ 3.4
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PTPRHQ9HD43 1115 aa36.32■■■■□ 3.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 LMBRD1Q9NUN5 540 aa36.32■■■■□ 3.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 COL4A6Q14031 1691 aa36.31■■■■□ 3.4
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CTDNEP1-209ENST00000574205 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa36.31■■■■□ 3.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 EXOC1Q9NV70 894 aa36.31■■■■□ 3.4
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ACCSQ96QU6 501 aa36.28■■■■□ 3.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 UBN1Q9NPG3 1134 aa36.28■■■■□ 3.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa36.28■■■■□ 3.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 MEIS3P2A8K0S8 358 aa36.27■■■■□ 3.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 ABLIM1O14639 778 aa36.27■■■■□ 3.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 KCNA1Q09470 495 aa36.27■■■■□ 3.4
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