RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541869.5

POLR1B-217, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene POLR1B, Length 5,059 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-217ENST00000541869 SEMA3FQ13275 785 aa11.03□□□□□ -0.64
POLR1B-217ENST00000541869 SPRYD7Q5W111 196 aa11.03□□□□□ -0.64
POLR1B-217ENST00000541869 SYT10Q6XYQ8 523 aa11.03□□□□□ -0.64
POLR1B-217ENST00000541869 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa11.03□□□□□ -0.64
POLR1B-217ENST00000541869 CCDC110Q8TBZ0 833 aa11.03□□□□□ -0.64
POLR1B-217ENST00000541869 SP110Q9HB58 689 aa11.03□□□□□ -0.64
POLR1B-217ENST00000541869 ARFGAP3Q9NP61 516 aa11.03□□□□□ -0.64
POLR1B-217ENST00000541869 RGL1Q9NZL6 768 aa11.03□□□□□ -0.64
POLR1B-217ENST00000541869 AGAP1Q9UPQ3 857 aa11.03□□□□□ -0.64
POLR1B-217ENST00000541869 SNX9Q9Y5X1 595 aa11.03□□□□□ -0.64
POLR1B-217ENST00000541869 KDM1AO60341 852 aa11.02□□□□□ -0.64
POLR1B-217ENST00000541869 MYL4P12829 197 aa11.02□□□□□ -0.64
POLR1B-217ENST00000541869 ACTR2P61160 394 aa11.02□□□□□ -0.64
POLR1B-217ENST00000541869 MICALCLQ6ZW33 695 aa11.02□□□□□ -0.64
POLR1B-217ENST00000541869 CROCCP2Q86T23 111 aa11.02□□□□□ -0.64
POLR1B-217ENST00000541869 VPS52Q8N1B4 723 aa11.02□□□□□ -0.64
POLR1B-217ENST00000541869 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa11.02□□□□□ -0.64
POLR1B-217ENST00000541869 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa11.02□□□□□ -0.64
POLR1B-217ENST00000541869 RWDD3Q9Y3V2 267 aa11.02□□□□□ -0.64
POLR1B-217ENST00000541869 GSTA1P08263 222 aa11.02□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 GSTA2P09210 222 aa11.02□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 MYBP10242 640 aa11.02□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 GHRP10912 638 aa11.02□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 SOX5P35711 763 aa11.02□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 MFSD10Q14728 455 aa11.02□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 RGL4Q8IZJ4 473 aa11.02□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 KCNQ5Q9NR82 932 aa11.02□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 SCINQ9Y6U3 715 aa11.02□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 A0A087WWV3 80 aa11.02□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 PSEN2P49810 448 aa11.02□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 LMNB2Q03252 620 aa11.02□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 RPS6KA2Q15349 733 aa11.02□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 FAM110CQ1W6H9 321 aa11.02□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 CRY2Q49AN0 593 aa11.02□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 CTXN3Q4LDR2 81 aa11.02□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 ZNF394Q53GI3 561 aa11.02□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 RESP18Q5W5W9 173 aa11.02□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 CALN1Q9BXU9 219 aa11.02□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 GPR25O00155 361 aa11.02□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 CAND2O75155 1236 aa11.02□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 VAMP7P51809 220 aa11.02□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 EVCP57679 992 aa11.02□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 NAALADL2Q58DX5 795 aa11.02□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 TBC1D19Q8N5T2 526 aa11.02□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 ZMYND12Q9H0C1 365 aa11.02□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 HIPK3Q9H422 1215 aa11.02□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 LCMT1Q9UIC8 334 aa11.02□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 VWA5AO00534 786 aa11.01□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 PPFIA4O75335 1185 aa11.01□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 ZNF235Q14590 738 aa11.01□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 STILQ15468 1287 aa11.01□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 RAB30Q15771 203 aa11.01□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 KRT39Q6A163 491 aa11.01□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 LRRC71Q8N4P6 559 aa11.01□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa11.01□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 RAB17Q9H0T7 212 aa11.01□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa11.01□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 SMIM23A6NLE4 172 aa11.01□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 GFPT2O94808 682 aa11.01□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 IRF1P10914 325 aa11.01□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 SEPT6Q14141 434 aa11.01□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 MESDQ14696 234 aa11.01□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 SLC45A4Q5BKX6 768 aa11.01□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 ZNF697Q5TEC3 545 aa11.01□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 STOX1Q6ZVD7 989 aa11.01□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 OOSP2Q86WS3 158 aa11.01□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 RABGGTAQ92696 567 aa11.01□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 GJB4Q9NTQ9 266 aa11.01□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa11.01□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 IL18RAPO95256 599 aa11.01□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 NPTXRO95502 500 aa11.01□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 SDC4P31431 198 aa11.01□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 LBX1P52954 281 aa11.01□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 ATF7IP2Q5U623 682 aa11.01□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa11.01□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 NT5DC4Q86YG4 428 aa11.01□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 IFT20Q8IY31 132 aa11.01□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 KAZALD1Q96I82 304 aa11.01□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 PRIMPOLQ96LW4 560 aa11.01□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 PHF20Q9BVI0 1012 aa11.01□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 FTHL17Q9BXU8 183 aa11.01□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 NDST4Q9H3R1 872 aa11.01□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 KCNK9Q9NPC2 374 aa11.01□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 ABCF3Q9NUQ8 709 aa11.01□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 MAP10Q9P2G4 905 aa11.01□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 ZNF148Q9UQR1 794 aa11.01□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 FAM170AA1A519 330 aa11.01□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 GCLMP48507 274 aa11.01□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 ADKP55263 362 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 SOX10P56693 466 aa11.01□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 CCDC149Q6ZUS6 474 aa11.01□□□□□ -0.65
POLR1B-217ENST00000541869 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms