RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533653.5

GMDS-AS1-211, humanhuman

TSL 2

Gene GMDS-AS1, Length 568 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-211ENST00000533653 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 B4GALT5O43286 388 aa18.06■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 STRN3Q13033 797 aa18.06■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GLB1LQ6UWU2 654 aa18.06■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 Q7L0L9 218 aa18.06■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FAM178BQ8IXR5 827 aa18.06■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MYCT1Q8N699 235 aa18.06■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DHX58Q96C10 678 aa18.06■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HVCN1Q96D96 273 aa18.06■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CPB2Q96IY4 423 aa18.06■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PLVAPQ9BX97 442 aa18.06■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa18.06■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PDZD7Q9H5P4 517 aa18.06■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 OLFML3Q9NRN5 406 aa18.06■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RNF19AQ9NV58 838 aa18.06■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HPSEQ9Y251 543 aa18.06■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 IPPQ9Y573 584 aa18.06■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TRANK1O15050 2925 aa18.06■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CITO14578 2027 aa18.05■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SFI1A8K8P3 1242 aa18.05■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 C5orf67F2Z3F1 127 aa18.05■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa18.05■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 INPPL1O15357 1258 aa18.05■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SLC16A4O15374 487 aa18.05■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TRAK2O60296 914 aa18.05■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ARHGEF15O94989 841 aa18.05■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MYL1P05976 194 aa18.05■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RB1P06400 928 aa18.05■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PFKFB1P16118 471 aa18.05■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TMEM132AQ24JP5 1023 aa18.05■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CLLU1OSQ5K130 101 aa18.05■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ATF7IP2Q5U623 682 aa18.05■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZPBP2Q6X784 338 aa18.05■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DNAJC19Q96DA6 116 aa18.05■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GUCD1Q96NT3 240 aa18.05■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 POLD4Q9HCU8 107 aa18.05■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TNFSF13BQ9Y275 285 aa18.05■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TBKBP1A7MCY6 615 aa18.04■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 K7ENM7 598 aa18.04■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SLFN14P0C7P3 912 aa18.04■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LINC00271P0C7V0 271 aa18.04■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FGFR1P11362 822 aa18.04■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ALCAMQ13740 583 aa18.04■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GRIN2CQ14957 1233 aa18.04■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DYMQ7RTS9 669 aa18.04■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TAS1R3Q7RTX0 852 aa18.04■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HAUS6Q7Z4H7 955 aa18.04■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CEP57L1Q8IYX8 460 aa18.04■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RNF169Q8NCN4 708 aa18.04■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CHAMP1Q96JM3 812 aa18.04■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CASD1Q96PB1 797 aa18.04■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FIZ1Q96SL8 496 aa18.04■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PANK2Q9BZ23 570 aa18.04■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TRIM9Q9C026 710 aa18.04■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RSAD1Q9HA92 442 aa18.04■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 AAASQ9NRG9 546 aa18.04■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 EDN1P05305 212 aa18.03■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LAG3P18627 525 aa18.03■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GATMP50440 423 aa18.03■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GTF2BQ00403 316 aa18.03■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 EPC2Q52LR7 807 aa18.03■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NT5DC1Q5TFE4 455 aa18.03■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CCDC65Q8IXS2 484 aa18.03■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TMEM192Q8IY95 271 aa18.03■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FBXO22Q8NEZ5 403 aa18.03■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 URGCPQ8TCY9 931 aa18.03■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ARNTL2Q8WYA1 636 aa18.03■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 P2RX5Q93086 422 aa18.03■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 C7orf25Q9BPX7 421 aa18.03■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZHX3Q9H4I2 956 aa18.03■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KANSL3Q9P2N6 904 aa18.03■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GIT1Q9Y2X7 761 aa18.03■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TOM1L1O75674 476 aa18.02■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NPTXRO95502 500 aa18.02■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PIGRP01833 764 aa18.02■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ITGA4P13612 1032 aa18.02■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LIG1P18858 919 aa18.02■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PROZP22891 400 aa18.02■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CTNNB1P35222 781 aa18.02■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SYKP43405 635 aa18.02■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZNF568Q3ZCX4 644 aa18.02■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 AGMOQ6ZNB7 445 aa18.02■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SFR1Q86XK3 245 aa18.02■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MAP4K3Q8IVH8 894 aa18.02■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FSIP1Q8NA03 581 aa18.02■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HELQQ8TDG4 1101 aa18.02■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CCDC34Q96HJ3 373 aa18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms