RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472760.1

PRPF40A-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF40A, Length 243 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-208ENST00000472760 JUNP05412 331 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 VSIG10L2P0DP72 767 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 EDNRBP24530 442 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 CFPP27918 469 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 ADCY7P51828 1080 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 WNT3AP56704 352 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 ACAP1Q15027 740 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 ATAT1Q5SQI0 421 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 PPP4R3AQ6IN85 833 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 PLEKHH3Q7Z736 793 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 SP8Q8IXZ3 490 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 OR2I1PQ8NGU4 316 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 SLC35G2Q8TBE7 412 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 ZNF480Q8WV37 535 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 HPS3Q969F9 1004 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 DBX1A6NMT0 343 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 VSTM5A8MXK1 200 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 ERC2O15083 957 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 PRC1O43663 620 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 DUSP2Q05923 314 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 IL10RAQ13651 578 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 NFYCQ13952 458 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 SEPT2Q15019 361 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 RNF151Q2KHN1 245 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 MST1LQ2TV78 715 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 PGS1Q32NB8 556 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 C3orf36Q3SXR2 165 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 RHOT1Q8IXI2 618 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 LGI4Q8N135 537 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 MVB12AQ96EY5 273 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 MANSC1Q9H8J5 431 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 GPRC5DQ9NZD1 345 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 NCDNQ9UBB6 729 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 NRP1O14786 923 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 MTSS1O43312 755 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 B4GALT3O60512 393 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 GASTP01350 101 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 GYPEP15421 78 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 RAC3P60763 192 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 HGFACQ04756 655 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 GAGE13Q4V321 117 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 Q6ZVL8 140 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 PQLC1Q8N2U9 271 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 PRR18Q8N4B5 295 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 PCGF6Q9BYE7 350 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 BCO1Q9HAY6 547 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 OBP2AQ9NY56 170 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 SASH1O94885 1247 aa6.23□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 CRHR1P34998 444 aa6.23□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 B3GNT9Q6UX72 402 aa6.23□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 DRC7Q8IY82 874 aa6.23□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 CAMKK1Q8N5S9 505 aa6.23□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 SYT8Q8NBV8 401 aa6.23□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 OR7D4Q8NG98 312 aa6.23□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 OR5M3Q8NGP4 307 aa6.23□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 CCHCR1Q8TD31 782 aa6.23□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 RABGGTAQ92696 567 aa6.23□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 KAT5Q92993 513 aa6.23□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa6.23□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 TAAR9Q96RI9 348 aa6.23□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 PRDM11Q9NQV5 511 aa6.23□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 TDP1Q9NUW8 608 aa6.23□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 SLC26A4O43511 780 aa6.22□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 TRIM13O60858 407 aa6.22□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 CAND2O75155 1236 aa6.22□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 ITGA10O75578 1167 aa6.22□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 BMP7P18075 431 aa6.22□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 SREBF1P36956 1147 aa6.22□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 CASRP41180 1078 aa6.22□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP6.22□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 TBX4P57082 545 aa6.22□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 PPP2CBP62714 309 aa6.22□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 PPP2CAP67775 309 aa6.22□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 SURF1Q15526 300 aa6.22□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 SLC4A10Q6U841 1118 aa6.22□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 TTC7BQ86TV6 843 aa6.22□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 RSPH3Q86UC2 560 aa6.22□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 C1QL4Q86Z23 238 aa6.22□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 CMTM4Q8IZR5 234 aa6.22□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms