RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434333.1

HLA-B-250, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

Gene HLA-B, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-250ENST00000434333 GIT2Q14161 759 aa22.32■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 TPRNQ4KMQ1 711 aa22.32■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 POTEGQ6S5H5 508 aa22.32■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 COLGALT2Q8IYK4 626 aa22.32■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 GAD1Q99259 594 aa22.32■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 ADAM7Q9H2U9 754 aa22.32■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 UBN1Q9NPG3 1134 aa22.32■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 FAN1Q9Y2M0 1017 aa22.32■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 ZNF318Q5VUA4 2279 aa22.32■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 LILRB3O75022 631 aa22.31■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 EFEMP2O95967 443 aa22.31■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 ALDH2P05091 517 aa22.31■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 RPA1P27694 616 aa22.31■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 ITIH3Q06033 890 aa22.31■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 DSC1Q08554 894 aa22.31■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 TTC38Q5R3I4 469 aa22.31■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 MAEAQ7L5Y9 396 aa22.31■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 NOSTRINQ8IVI9 506 aa22.31■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 C4orf32Q8N8J7 132 aa22.31■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 FEZF2Q8TBJ5 459 aa22.31■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 ZFP42Q96MM3 310 aa22.31■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 POMKQ9H5K3 350 aa22.31■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 A0A1B0GUA9 196 aa22.3■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 RBM25P49756 843 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 SCNN1GP51170 649 aa22.3■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 ZXDAP98168 799 aa22.3■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 NBR1Q14596 966 aa22.3■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 KANK3Q6NY19 840 aa22.3■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa22.3■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 TRIM67Q6ZTA4 783 aa22.3■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 GSTCDQ8NEC7 633 aa22.3■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 MCPH1Q8NEM0 835 aa22.3■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 BSNDQ8WZ55 320 aa22.3■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 NACC1Q96RE7 527 aa22.3■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 WDFY4Q6ZS81 3184 aa22.3■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 LRRIQ4A6NIV6 560 aa22.29■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 SP100P23497 879 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 TRAPPC10P48553 1259 aa22.29■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa22.29■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 FAM184AQ8NB25 1140 aa22.29■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 KLHL5Q96PQ7 755 aa22.29■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 APOL6Q9BWW8 343 aa22.29■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 DZANK1Q9NVP4 752 aa22.29■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 STK39Q9UEW8 545 aa22.29■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 GIT1Q9Y2X7 761 aa22.29■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 MUC6Q6W4X9 2439 aa22.29■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 TTLL13PA6NNM8 815 aa22.28■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 F8W810 466 aa22.28■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 NPTXRO95502 500 aa22.28■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 SOD2P04179 222 aa22.28■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP22.28■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 CNPP09543 421 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 WEE2P0C1S8 567 aa22.28■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP22.28■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 ECM1Q16610 540 aa22.28■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 CES5AQ6NT32 575 aa22.28■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 SLC27A1Q6PCB7 646 aa22.28■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 TAS1R1Q7RTX1 841 aa22.28■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 NECTIN4Q96NY8 510 aa22.28■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa22.28■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 FZD8Q9H461 694 aa22.28■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 DENND4AQ7Z401 1863 aa22.28■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 TMEM221A6NGB7 291 aa22.27■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 M0R296 226 aa22.27■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 CYP11B2P19099 503 aa22.27■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 MUTP22033 750 aa22.27■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 AKAP5P24588 427 aa22.27■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 OR1G1P47890 313 aa22.27■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 CLCN4P51793 760 aa22.27■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 PTPN21Q16825 1174 aa22.27■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 FAM187BQ17R55 369 aa22.27■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 KIAA1841Q6NSI8 718 aa22.27■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 PADI6Q6TGC4 694 aa22.27■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 ERMNQ8TAM6 284 aa22.27■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 PRIMPOLQ96LW4 560 aa22.27■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa22.26■■□□□ 1.15
HLA-B-250ENST00000434333 C2CD4DB7Z1M9 353 aa22.26■■□□□ 1.15
HLA-B-250ENST00000434333 EDN1P05305 212 aa22.26■■□□□ 1.15
HLA-B-250ENST00000434333 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
HLA-B-250ENST00000434333 MTHFRP42898 656 aa22.26■■□□□ 1.15
HLA-B-250ENST00000434333 PPFIBP1Q86W92 1011 aa22.26■■□□□ 1.15
HLA-B-250ENST00000434333 TMEM87AQ8NBN3 555 aa22.26■■□□□ 1.15
HLA-B-250ENST00000434333 CCDC113Q9H0I3 377 aa22.26■■□□□ 1.15
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