RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028157.8

Gtf3c5-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c5, Length 2,739 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Magea1O89006 320 aa14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mt-CybP00158 381 aa14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 MycnP03966 462 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Usp4P35123 962 aa14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 SpoplQ2M2N2 392 aa14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Nr1d1Q3UV55 615 aa14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Sema5bQ60519 1093 aa14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ugt1a9Q62452 528 aa14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Dhx32Q8BZS9 744 aa14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Vps36Q91XD6 386 aa14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Alg1Q921Q3 482 aa14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Vta1Q9CR26 309 aa14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rnf225Q9D7D1 332 aa14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olig1Q9JKN5 260 aa14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Nudt5Q9JKX6 218 aa14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Magea2Q9R2A2 320 aa14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tnip1Q9WUU8 647 aa14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Samd15F6XZJ7 620 aa14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm6121L7MUF1 212 aa14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Vmn2r15L7N2A0 855 aa14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 SpibO35906 267 aa14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Stk10O55098 966 aa14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Epha3P29319 983 aa14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 LipeP54310 759 aa14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Erich4Q3UNU4 136 aa14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 FancbQ5XJY6 703 aa14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 OgdhQ60597 1023 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Srd5a1Q68FF9 255 aa14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Wrap53Q8VC51 532 aa14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Dr1Q91WV0 176 aa14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Dydc1Q9D9T0 175 aa14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Scgb2b20Q9JI02 112 aa14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 FibpQ9JI19 357 aa14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Col4a3Q9QZS0 1669 aa14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Dcdc2bF7BCK0 340 aa14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Apba3O88888 571 aa14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Surf6P70279 355 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rufy1Q8BIJ7 712 aa14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rint1Q8BZ36 792 aa14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Epc2Q8C0I4 808 aa14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Spats2Q8K1N4 545 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Smc6Q924W5 1097 aa14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Q9CYI0 393 aa14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Kank3Q9Z1P7 791 aa14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fbf1A2A870 1173 aa14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ccdc24E9PUW8 296 aa14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Hoxc10P31257 342 aa14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 LeprP48356 1162 aa14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Myo1fP70248 1099 aa14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Atp11aP98197 1187 aa14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Bbof1Q3V079 533 aa14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ccdc181Q80ZU5 509 aa14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Micall1Q8BGT6 870 aa14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fam177a1Q8BR63 207 aa14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ddx39aQ8VDW0 427 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tnpo2Q99LG2 887 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fam173bQ9D1Z3 247 aa14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 MesdQ9ERE7 224 aa14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ddx20Q9JJY4 825 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Polr2aP08775 1970 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Abcb11Q9QY30 1321 aa14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Myh10Q61879 1976 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Arhgef10lA2AWP8 1280 aa14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm44503E9PYU5 387 aa14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 RargP18911 458 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fmr1P35922 614 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 VegfaQ00731 214 aa14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Kmt5aQ2YDW7 349 aa14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ctc1Q5SUQ9 1212 aa14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rgl2Q61193 778 aa14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rps6ka6Q7TPS0 764 aa14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Trim6Q8BGE7 488 aa14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Usp37Q8C0R0 979 aa14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 OscarQ8VBT3 265 aa14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 BrdtQ91Y44 956 aa14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ttc1Q91Z38 292 aa14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ankef1Q9D2J7 775 aa14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gap43P06837 227 aa14.65□□□□□ -0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Hspa9P38647 679 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Serpinb6dQ3UWK8 375 aa14.65□□□□□ -0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Wdr18Q4VBE8 431 aa14.65□□□□□ -0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pick1Q62083 416 aa14.65□□□□□ -0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ddx55Q6ZPL9 600 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 GopcQ8BH60 463 aa14.65□□□□□ -0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Leg1Q8C6C9 337 aa14.65□□□□□ -0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cyp2d26Q8CIM7 500 aa14.65□□□□□ -0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tsnaxip1Q99P25 704 aa14.65□□□□□ -0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Emc2Q9CRD2 297 aa14.65□□□□□ -0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Grk1Q9WVL4 564 aa14.65□□□□□ -0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Clca3bE9PUL3 1044 aa14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 E9QMW4 1145 aa14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 4933406M09RikG3XA12 479 aa14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Xrcc5P27641 732 aa14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tmprss11aQ3UQ41 389 aa14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tgfbrap1Q3UR70 860 aa14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 EsrrbQ61539 433 aa14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Calhm6Q8C9E8 313 aa14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tmem63bQ3TWI9 832 aa14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cct8l1Q80YT3 562 aa14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Q8BGD0 127 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 40.1 ms