Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC44.67■■■■■ 4.74
Hoxc10P31257 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
Hoxc10P31257 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
Hoxc10P31257 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
Hoxc10P31257 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
Hoxc10P31257 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC38■■■■□ 3.67
Hoxc10P31257 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Hoxc10P31257 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Hoxc10P31257 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Hoxc10P31257 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Hoxc10P31257 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
Hoxc10P31257 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Hoxc10P31257 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Hoxc10P31257 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Hoxc10P31257 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Hoxc10P31257 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
Hoxc10P31257 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Hoxc10P31257 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Hoxc10P31257 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Hoxc10P31257 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Hoxc10P31257 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Hoxc10P31257 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Hoxc10P31257 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
Hoxc10P31257 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Hoxc10P31257 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Hoxc10P31257 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Hoxc10P31257 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Hoxc10P31257 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Hoxc10P31257 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Hoxc10P31257 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
Hoxc10P31257 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Hoxc10P31257 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Hoxc10P31257 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Hoxc10P31257 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
Hoxc10P31257 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Hoxc10P31257 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Hoxc10P31257 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Hoxc10P31257 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Hoxc10P31257 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Hoxc10P31257 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Hoxc10P31257 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Hoxc10P31257 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Hoxc10P31257 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Hoxc10P31257 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Hoxc10P31257 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Hoxc10P31257 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Hoxc10P31257 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Hoxc10P31257 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Hoxc10P31257 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Hoxc10P31257 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Hoxc10P31257 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Hoxc10P31257 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Hoxc10P31257 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Hoxc10P31257 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Hoxc10P31257 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Hoxc10P31257 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Hoxc10P31257 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Hoxc10P31257 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Hoxc10P31257 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Hoxc10P31257 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Hoxc10P31257 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Hoxc10P31257 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Hoxc10P31257 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Hoxc10P31257 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Hoxc10P31257 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Hoxc10P31257 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Hoxc10P31257 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Hoxc10P31257 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Hoxc10P31257 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Hoxc10P31257 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Hoxc10P31257 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Hoxc10P31257 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Hoxc10P31257 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Hoxc10P31257 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Hoxc10P31257 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Hoxc10P31257 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Hoxc10P31257 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Hoxc10P31257 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Hoxc10P31257 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Hoxc10P31257 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Hoxc10P31257 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Hoxc10P31257 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Hoxc10P31257 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Hoxc10P31257 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Hoxc10P31257 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Hoxc10P31257 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Hoxc10P31257 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Hoxc10P31257 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Hoxc10P31257 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Hoxc10P31257 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Hoxc10P31257 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Hoxc10P31257 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Hoxc10P31257 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Hoxc10P31257 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
Hoxc10P31257 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Hoxc10P31257 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Hoxc10P31257 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Hoxc10P31257 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Hoxc10P31257 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Hoxc10P31257 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.2 ms