Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
Xrcc5P27641 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Xrcc5P27641 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Xrcc5P27641 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Xrcc5P27641 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Xrcc5P27641 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Xrcc5P27641 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Xrcc5P27641 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
Xrcc5P27641 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Xrcc5P27641 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
Xrcc5P27641 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Xrcc5P27641 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Xrcc5P27641 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Xrcc5P27641 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Xrcc5P27641 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Xrcc5P27641 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Xrcc5P27641 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Xrcc5P27641 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Xrcc5P27641 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Xrcc5P27641 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
Xrcc5P27641 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Xrcc5P27641 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Xrcc5P27641 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Xrcc5P27641 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Xrcc5P27641 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Xrcc5P27641 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Xrcc5P27641 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Xrcc5P27641 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Xrcc5P27641 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Xrcc5P27641 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Xrcc5P27641 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Xrcc5P27641 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Xrcc5P27641 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Xrcc5P27641 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Xrcc5P27641 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Xrcc5P27641 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Xrcc5P27641 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Xrcc5P27641 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Xrcc5P27641 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Xrcc5P27641 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Xrcc5P27641 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
Xrcc5P27641 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Xrcc5P27641 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Xrcc5P27641 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Xrcc5P27641 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
Xrcc5P27641 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Xrcc5P27641 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Xrcc5P27641 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Xrcc5P27641 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Xrcc5P27641 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Xrcc5P27641 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Xrcc5P27641 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Xrcc5P27641 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Xrcc5P27641 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Xrcc5P27641 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Xrcc5P27641 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Xrcc5P27641 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Xrcc5P27641 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Xrcc5P27641 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Xrcc5P27641 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Xrcc5P27641 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Xrcc5P27641 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Xrcc5P27641 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Xrcc5P27641 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Xrcc5P27641 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Xrcc5P27641 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Xrcc5P27641 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Xrcc5P27641 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Xrcc5P27641 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Xrcc5P27641 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Xrcc5P27641 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Xrcc5P27641 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Xrcc5P27641 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Xrcc5P27641 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Xrcc5P27641 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Xrcc5P27641 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Xrcc5P27641 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Xrcc5P27641 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Xrcc5P27641 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Xrcc5P27641 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Xrcc5P27641 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Xrcc5P27641 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Xrcc5P27641 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Xrcc5P27641 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Xrcc5P27641 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Xrcc5P27641 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Xrcc5P27641 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Xrcc5P27641 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Xrcc5P27641 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Xrcc5P27641 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Xrcc5P27641 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Xrcc5P27641 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Xrcc5P27641 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Xrcc5P27641 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Xrcc5P27641 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Xrcc5P27641 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Xrcc5P27641 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Xrcc5P27641 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Xrcc5P27641 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Xrcc5P27641 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
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