Protein–RNA interactions for Protein: F6XZJ7

Samd15, Sterile alpha motif domain-containing protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd15F6XZJ7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Samd15F6XZJ7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
Samd15F6XZJ7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Samd15F6XZJ7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Samd15F6XZJ7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Samd15F6XZJ7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Samd15F6XZJ7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Samd15F6XZJ7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Samd15F6XZJ7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Samd15F6XZJ7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Samd15F6XZJ7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Samd15F6XZJ7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Samd15F6XZJ7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Samd15F6XZJ7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Samd15F6XZJ7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Samd15F6XZJ7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
Samd15F6XZJ7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
Samd15F6XZJ7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Samd15F6XZJ7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Samd15F6XZJ7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Samd15F6XZJ7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Samd15F6XZJ7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Samd15F6XZJ7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Samd15F6XZJ7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Samd15F6XZJ7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Samd15F6XZJ7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Samd15F6XZJ7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Samd15F6XZJ7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Samd15F6XZJ7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Samd15F6XZJ7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Samd15F6XZJ7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Samd15F6XZJ7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Samd15F6XZJ7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Samd15F6XZJ7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Samd15F6XZJ7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Samd15F6XZJ7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Samd15F6XZJ7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Samd15F6XZJ7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Samd15F6XZJ7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Samd15F6XZJ7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Samd15F6XZJ7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Samd15F6XZJ7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Samd15F6XZJ7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Samd15F6XZJ7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Samd15F6XZJ7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Samd15F6XZJ7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Samd15F6XZJ7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Samd15F6XZJ7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Samd15F6XZJ7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Samd15F6XZJ7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Samd15F6XZJ7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Samd15F6XZJ7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Samd15F6XZJ7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Samd15F6XZJ7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Samd15F6XZJ7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Samd15F6XZJ7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Samd15F6XZJ7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Samd15F6XZJ7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Samd15F6XZJ7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Samd15F6XZJ7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Samd15F6XZJ7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Samd15F6XZJ7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Samd15F6XZJ7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Samd15F6XZJ7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Samd15F6XZJ7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Samd15F6XZJ7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Samd15F6XZJ7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Samd15F6XZJ7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Samd15F6XZJ7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Samd15F6XZJ7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Samd15F6XZJ7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Samd15F6XZJ7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Samd15F6XZJ7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Samd15F6XZJ7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Samd15F6XZJ7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Samd15F6XZJ7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Samd15F6XZJ7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Samd15F6XZJ7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Samd15F6XZJ7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Samd15F6XZJ7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Samd15F6XZJ7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Samd15F6XZJ7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Samd15F6XZJ7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Samd15F6XZJ7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Samd15F6XZJ7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Samd15F6XZJ7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Samd15F6XZJ7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Samd15F6XZJ7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Samd15F6XZJ7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Samd15F6XZJ7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Samd15F6XZJ7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Samd15F6XZJ7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Samd15F6XZJ7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Samd15F6XZJ7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Samd15F6XZJ7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Samd15F6XZJ7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Samd15F6XZJ7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Samd15F6XZJ7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Samd15F6XZJ7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Samd15F6XZJ7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 6.9 ms