Protein–RNA interactions for Protein: Q921Q3

Alg1, Chitobiosyldiphosphodolichol beta-mannosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alg1Q921Q3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Alg1Q921Q3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Alg1Q921Q3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Alg1Q921Q3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Alg1Q921Q3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Alg1Q921Q3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Alg1Q921Q3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Alg1Q921Q3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Alg1Q921Q3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Alg1Q921Q3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Alg1Q921Q3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Alg1Q921Q3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Alg1Q921Q3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Alg1Q921Q3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Alg1Q921Q3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Alg1Q921Q3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Alg1Q921Q3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Alg1Q921Q3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
Alg1Q921Q3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Alg1Q921Q3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Alg1Q921Q3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Alg1Q921Q3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Alg1Q921Q3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Alg1Q921Q3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Alg1Q921Q3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Alg1Q921Q3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Alg1Q921Q3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Alg1Q921Q3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Alg1Q921Q3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Alg1Q921Q3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Alg1Q921Q3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Alg1Q921Q3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Alg1Q921Q3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Alg1Q921Q3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Alg1Q921Q3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Alg1Q921Q3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Alg1Q921Q3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Alg1Q921Q3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Alg1Q921Q3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Alg1Q921Q3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Alg1Q921Q3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Alg1Q921Q3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Alg1Q921Q3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Alg1Q921Q3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Alg1Q921Q3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Alg1Q921Q3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Alg1Q921Q3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Alg1Q921Q3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Alg1Q921Q3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Alg1Q921Q3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Alg1Q921Q3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Alg1Q921Q3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Alg1Q921Q3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Alg1Q921Q3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Alg1Q921Q3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Alg1Q921Q3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Alg1Q921Q3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Alg1Q921Q3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Alg1Q921Q3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Alg1Q921Q3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Alg1Q921Q3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Alg1Q921Q3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Alg1Q921Q3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Alg1Q921Q3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Alg1Q921Q3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Alg1Q921Q3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Alg1Q921Q3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Alg1Q921Q3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Alg1Q921Q3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Alg1Q921Q3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Alg1Q921Q3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Alg1Q921Q3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Alg1Q921Q3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Alg1Q921Q3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Alg1Q921Q3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Alg1Q921Q3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Alg1Q921Q3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Alg1Q921Q3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Alg1Q921Q3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Alg1Q921Q3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Alg1Q921Q3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Alg1Q921Q3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Alg1Q921Q3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Alg1Q921Q3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Alg1Q921Q3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Alg1Q921Q3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Alg1Q921Q3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Alg1Q921Q3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Alg1Q921Q3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Alg1Q921Q3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Alg1Q921Q3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Alg1Q921Q3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Alg1Q921Q3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Alg1Q921Q3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Alg1Q921Q3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Alg1Q921Q3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Alg1Q921Q3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Alg1Q921Q3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Alg1Q921Q3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Alg1Q921Q3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms