Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

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Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
Trim6Q8BGE7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Trim6Q8BGE7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Trim6Q8BGE7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
Trim6Q8BGE7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Trim6Q8BGE7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Trim6Q8BGE7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Trim6Q8BGE7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Trim6Q8BGE7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Trim6Q8BGE7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Trim6Q8BGE7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Trim6Q8BGE7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
Trim6Q8BGE7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Trim6Q8BGE7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Trim6Q8BGE7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Trim6Q8BGE7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Trim6Q8BGE7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Trim6Q8BGE7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Trim6Q8BGE7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Trim6Q8BGE7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Trim6Q8BGE7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Trim6Q8BGE7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Trim6Q8BGE7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Trim6Q8BGE7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Trim6Q8BGE7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Trim6Q8BGE7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Trim6Q8BGE7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Trim6Q8BGE7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Trim6Q8BGE7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Trim6Q8BGE7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Trim6Q8BGE7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Trim6Q8BGE7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
Trim6Q8BGE7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Trim6Q8BGE7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Trim6Q8BGE7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Trim6Q8BGE7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Trim6Q8BGE7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Trim6Q8BGE7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Trim6Q8BGE7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Trim6Q8BGE7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Trim6Q8BGE7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Trim6Q8BGE7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
Trim6Q8BGE7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Trim6Q8BGE7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Trim6Q8BGE7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Trim6Q8BGE7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Trim6Q8BGE7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Trim6Q8BGE7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Trim6Q8BGE7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Trim6Q8BGE7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Trim6Q8BGE7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Trim6Q8BGE7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Trim6Q8BGE7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Trim6Q8BGE7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Trim6Q8BGE7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Trim6Q8BGE7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Trim6Q8BGE7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Trim6Q8BGE7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Trim6Q8BGE7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Trim6Q8BGE7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Trim6Q8BGE7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Trim6Q8BGE7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Trim6Q8BGE7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Trim6Q8BGE7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Trim6Q8BGE7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Trim6Q8BGE7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Trim6Q8BGE7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Trim6Q8BGE7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Trim6Q8BGE7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Trim6Q8BGE7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Trim6Q8BGE7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Trim6Q8BGE7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Trim6Q8BGE7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Trim6Q8BGE7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Trim6Q8BGE7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Trim6Q8BGE7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Trim6Q8BGE7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Trim6Q8BGE7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trim6Q8BGE7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Trim6Q8BGE7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Trim6Q8BGE7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Trim6Q8BGE7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Trim6Q8BGE7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trim6Q8BGE7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Trim6Q8BGE7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trim6Q8BGE7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trim6Q8BGE7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trim6Q8BGE7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Trim6Q8BGE7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Trim6Q8BGE7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trim6Q8BGE7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trim6Q8BGE7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Trim6Q8BGE7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Trim6Q8BGE7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Trim6Q8BGE7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trim6Q8BGE7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Trim6Q8BGE7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trim6Q8BGE7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Trim6Q8BGE7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Trim6Q8BGE7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
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