RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 SftpdP50404 374 aa13.67□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Srrm1Q52KI8 946 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mrgprb8Q7TN51 330 aa13.67□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pak4Q8BTW9 593 aa13.67□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pdik1lQ8QZR7 341 aa13.67□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Snx24Q9CRB0 169 aa13.67□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PfkpQ9WUA3 784 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Klrk1O54709 232 aa13.66□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc10a5Q5PT54 434 aa13.66□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam214aQ69ZK7 1075 aa13.66□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 C2cd5Q7TPS5 1016 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 MyripQ8K3I4 856 aa13.66□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prmt7Q922X9 692 aa13.66□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cep72Q9D3R3 646 aa13.66□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gucy1a3Q9ERL9 691 aa13.66□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vnn1Q9Z0K8 512 aa13.66□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lonrf2B2RT44 518 aa13.66□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mboat4P0C7A3 435 aa13.66□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pcsk1P63239 753 aa13.66□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Bzw1Q9CQC6 419 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CacybpQ9CXW3 229 aa13.66□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Supt3B0QZW4 406 aa13.66□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Krt36B1AQ75 473 aa13.66□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 SelenovD3YXG1 328 aa13.66□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 BhmtO35490 407 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gucy2eP52785 1108 aa13.66□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Znf532Q6NXK2 1036 aa13.66□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PoliQ6R3M4 717 aa13.66□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dusp4Q8BFV3 398 aa13.66□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 RadxQ8C779 850 aa13.66□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem132cQ8CEF9 1099 aa13.66□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 SncbQ91ZZ3 133 aa13.66□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q922C1 641 aa13.66□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Xab2Q9DCD2 855 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 AurkbO70126 345 aa13.66□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Casp14O89094 257 aa13.66□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Krt10P02535 570 aa13.66□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pgk2P09041 417 aa13.66□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Odr4Q4PJX1 447 aa13.66□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mief2Q5NCS9 454 aa13.66□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pabpn1lQ5XFR0 273 aa13.66□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hsph1Q61699 858 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Smarca1Q6PGB8 1046 aa13.66□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmco4Q91WU4 631 aa13.66□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ift172Q6VH22 1749 aa13.65□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm3095E9Q058 166 aa13.65□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccr1P51675 355 aa13.65□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pfdn6Q03958 127 aa13.65□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rnf180Q3U827 592 aa13.65□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Agap2Q3UHD9 1186 aa13.65□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Arhgap15Q811M1 481 aa13.65□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rpn1Q91YQ5 608 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gabbr1Q9WV18 960 aa13.65□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Disp2Q8CIP5 1345 aa13.65□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 AtrnQ9WU60 1428 aa13.65□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Surf6P70279 355 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ptgs2Q05769 604 aa13.65□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 OsbpQ3B7Z2 805 aa13.65□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam193bQ3U2K0 892 aa13.65□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ppp4r3cQ3V0Y1 813 aa13.65□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Celf6Q7TN33 460 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem260Q8BMD6 703 aa13.65□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm29133A0A1B0GT72 266 aa13.65□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm7086A0A1W2P766 342 aa13.65□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rfx8D3YU81 596 aa13.65□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Usp17ldG5E8G2 545 aa13.65□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Usp17lcG5E8I7 545 aa13.65□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Men1O88559 611 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ndufs6P52503 116 aa13.65□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Psmc6P62334 389 aa13.65□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lrriq3Q14DL3 633 aa13.65□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 FancbQ5XJY6 703 aa13.65□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Psmd5Q8BJY1 504 aa13.65□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prpf31Q8CCF0 499 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Usp15Q8R5H1 981 aa13.65□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pcdha11Q91Y19 950 aa13.65□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rassf3Q99P51 232 aa13.65□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mageb3Q9D2H4 330 aa13.65□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm5926E9PWJ8 236 aa13.64□□□□□ -0.23
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Aknad1E9Q8N6 675 aa13.64□□□□□ -0.23
Pkp1-201ENSMUST00000027667 2610008E11RikG3X964 669 aa13.64□□□□□ -0.23
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trappc3O55013 180 aa13.64□□□□□ -0.23
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mdh1P14152 334 aa13.64□□□□□ -0.23
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Skap1Q3UUV5 355 aa13.64□□□□□ -0.23
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nr1d1Q3UV55 615 aa13.64□□□□□ -0.23
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Irak1Q62406 710 aa13.64□□□□□ -0.23
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tdpoz2Q717B2 364 aa13.64□□□□□ -0.23
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sirt2Q8VDQ8 389 aa13.64□□□□□ -0.23
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Chn1Q91V57 459 aa13.64□□□□□ -0.23
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ubr1O70481 1757 aa13.64□□□□□ -0.23
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cdr1E9Q0B4 517 aa13.64□□□□□ -0.23
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mmp10O55123 476 aa13.64□□□□□ -0.23
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PltpP55065 493 aa13.64□□□□□ -0.23
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cyp2c39P56656 490 aa13.64□□□□□ -0.23
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Neurl1bQ0MW30 546 aa13.64□□□□□ -0.23
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nr2c1Q505F1 590 aa13.64□□□□□ -0.23
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vil1Q62468 827 aa13.64□□□□□ -0.23
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fsd1lQ8BYN5 507 aa13.64□□□□□ -0.23
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr805Q8VFI4 319 aa13.64□□□□□ -0.23
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pqbp1Q91VJ5 263 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 17.7 ms