Protein–RNA interactions for Protein: P02535

Krt10, Keratin, type I cytoskeletal 10, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt10P02535 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36,25■■■■□ 3,39
Krt10P02535 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,72■■■■□ 3,15
Krt10P02535 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,72■■■□□ 2,99
Krt10P02535 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,54■■■□□ 2,96
Krt10P02535 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33,18■■■□□ 2,9
Krt10P02535 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,86■■■□□ 2,85
Krt10P02535 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32,34■■■□□ 2,77
Krt10P02535 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32,33■■■□□ 2,77
Krt10P02535 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,2■■■□□ 2,75
Krt10P02535 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,7■■■□□ 2,67
Krt10P02535 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31,7■■■□□ 2,67
Krt10P02535 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,63
Krt10P02535 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31,44■■■□□ 2,62
Krt10P02535 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,23■■■□□ 2,59
Krt10P02535 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Krt10P02535 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Krt10P02535 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
Krt10P02535 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31,07■■■□□ 2,56
Krt10P02535 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Krt10P02535 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
Krt10P02535 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,54
Krt10P02535 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
Krt10P02535 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
Krt10P02535 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Krt10P02535 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
Krt10P02535 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Krt10P02535 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30,55■■■□□ 2,48
Krt10P02535 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,47
Krt10P02535 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Krt10P02535 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30,39■■■□□ 2,46
Krt10P02535 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
Krt10P02535 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30,31■■■□□ 2,44
Krt10P02535 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Krt10P02535 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Krt10P02535 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Krt10P02535 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Krt10P02535 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Krt10P02535 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Krt10P02535 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Krt10P02535 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Krt10P02535 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29,77■■■□□ 2,36
Krt10P02535 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29,75■■■□□ 2,35
Krt10P02535 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29,74■■■□□ 2,35
Krt10P02535 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29,72■■■□□ 2,35
Krt10P02535 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29,62■■■□□ 2,33
Krt10P02535 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29,58■■■□□ 2,33
Krt10P02535 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Krt10P02535 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Krt10P02535 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Krt10P02535 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Krt10P02535 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Krt10P02535 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Krt10P02535 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Krt10P02535 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28,95■■■□□ 2,23
Krt10P02535 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28,95■■■□□ 2,22
Krt10P02535 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Krt10P02535 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Krt10P02535 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Krt10P02535 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Krt10P02535 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28,76■■■□□ 2,19
Krt10P02535 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Krt10P02535 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28,75■■■□□ 2,19
Krt10P02535 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28,72■■■□□ 2,19
Krt10P02535 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,7■■■□□ 2,19
Krt10P02535 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Krt10P02535 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Krt10P02535 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Krt10P02535 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Krt10P02535 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,55■■■□□ 2,16
Krt10P02535 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28,55■■■□□ 2,16
Krt10P02535 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Krt10P02535 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Krt10P02535 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,47■■■□□ 2,15
Krt10P02535 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28,47■■■□□ 2,15
Krt10P02535 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Krt10P02535 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28,39■■■□□ 2,14
Krt10P02535 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Krt10P02535 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,13
Krt10P02535 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Krt10P02535 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Krt10P02535 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,35■■■□□ 2,13
Krt10P02535 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Krt10P02535 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28,33■■■□□ 2,13
Krt10P02535 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Krt10P02535 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Krt10P02535 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28,18■■■□□ 2,1
Krt10P02535 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Krt10P02535 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Krt10P02535 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Krt10P02535 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Krt10P02535 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,08
Krt10P02535 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Krt10P02535 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Krt10P02535 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Krt10P02535 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Krt10P02535 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,98■■■□□ 2,07
Krt10P02535 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Krt10P02535 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Krt10P02535 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Krt10P02535 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27,92■■■□□ 2,06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,3 ms