RNA–Protein interactions for RNA: YOR259C

RPT4, Transcript of ATPase of the 19S regulatory particle of the 26S proteasome, yeast

Gene RPT4, Length 1,314 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPT4	YOR259C	YEH1	Q07804	573 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	ATG10	Q07879	167 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	CRT10	Q08226	957 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
RPT4	YOR259C	TY2A-B	Q12260	438 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	YRM1	Q12340	786 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	RKM5	Q12367	367 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	YMR084W	A2P2R3	262 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	ARG80	P07249	177 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	CDC23	P16522	626 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	YCR061W	P25639	631 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	CTS1	P29029	562 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	ITR1	P30605	584 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	VAM7	P32912	316 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	VPS17	P32913	551 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	SFC1	P33303	322 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	CHL4	P38907	458 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	RIP-Chip
RPT4	YOR259C	HIS6	P40545	261 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	PFA3	P42836	336 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	RPE1	P46969	238 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	MCM22	P47167	239 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	DOC1	P53068	250 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	SAY1	P53324	424 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	PGA1	P53896	198 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	SNX41	Q04053	625 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	PLM2	Q04383	521 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	SPC3	Q12133	184 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	PSF1	Q12488	208 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	YKR104W	P0CE69	306 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	YSR3	P23501	404 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	STE50	P25344	346 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	NTH1	P32356	751 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	ECM25	P32525	599 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	MTH1	P35198	433 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	SCO2	P38072	301 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	DTR1	P38125	572 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	THI2	P38141	450 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	PAU24	P38155	120 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	GID8	P40208	455 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	SDP1	P40479	209 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	POP1	P41812	875 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	TAD2	P47058	250 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	IBA57	P47158	497 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	SNN1	P48232	102 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	NUP57	P48837	541 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	PMT5	P52867	743 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	YGL159W	P53110	370 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	PAU12	P53343	120 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	DCR2	Q05924	578 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	BOP2	Q06150	570 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	TMS1	Q12116	473 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	INP53	Q12271	1107 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	EAF3	Q12432	401 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	SKS1	Q12505	502 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	PCC1	Q3E833	88 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	GAL1	P04385	528 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	PRB1	P09232	635 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	ERD1	P16151	362 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	APN1	P22936	367 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	MRP17	P28778	131 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	MRP20	P32387	263 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	APD1	P38281	316 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	PZF1	P39933	429 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	LOH1	P47055	219 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	SSN8	P47821	323 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	SDT1	P53078	280 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	ASI3	P53983	676 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	TGL2	P54857	326 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	YDR541C	Q03049	344 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	BNA7	Q04066	261 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	HLR1	Q04429	423 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	YLR352W	Q06479	807 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	ANT1	Q06497	328 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	XYL2	Q07993	356 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	ISN1	Q99312	450 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	YOL162W	P0CF19	215 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	YOL163W	P0CF20	169 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	BOS1	P25385	244 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	CWH43	P25618	953 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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