RNA–Protein interactions for RNA: YOR116C

RPO31, Transcript of RNA polymerase III largest subunit C160, yeast

Gene RPO31, Length 4,383 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPO31	YOR116C	YLR413W	Q06689	675 aa		3.59	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	IRC10	Q08118	586 aa		3.59	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	AEP3	Q12089	606 aa		3.59	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	ACH1	P32316	526 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	DAL3	P32459	195 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	YKR051W	P36142	418 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	GAT2	P40209	560 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	PHO23	P50947	330 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	YFH1	Q07540	174 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	ISU2	Q12056	156 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	SIR2	P06700	562 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	MOB2	P43563	287 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	YNR065C	P53751	1116 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	MRPL22	P53881	309 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	HRD1	Q08109	551 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	GPM2	Q12008	311 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	ECM3	Q99252	613 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	PBS2	P08018	668 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	GAL7	P08431	366 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	PET54	P10834	293 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	HEM15	P16622	393 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	NPR1	P22211	790 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	CPR4	P25334	318 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	MTC2	P34246	357 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	EHT1	P38295	451 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	VHR1	P40522	640 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	GAB1	P41733	394 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	DIA3	P52290	468 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	GPI15	P53961	229 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	YDR249C	Q03787	373 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	PLM2	Q04383	521 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	MSC3	Q05812	728 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	PAM18	Q07914	168 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	RSC58	Q07979	502 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	YOR022C	Q12204	715 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	TY1A-BL	Q12266	440 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	ISN1	Q99312	450 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	MRPL6	P32904	214 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	UPS2	P35200	230 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	DTR1	P38125	572 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	YHR112C	P38716	378 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	BOL3	P39724	118 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	ERV46	P39727	415 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	AVT7	P40501	490 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	XPT1	P47165	209 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	TOS2	P50078	622 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	HST3	P53687	447 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	ADD37	Q03233	198 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	GIS1	Q03833	894 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	GIC2	Q06648	383 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	MHT1	Q12525	324 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	GEX2	P36173	615 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	CTP1	P38152	299 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	RRN10	P38204	145 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	FMO1	P38866	432 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	SPO73	P40031	143 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	LCB2	P40970	561 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	YJR056C	P47115	236 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	HHO1	P53551	258 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	HXT15	P54854	567 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	SCP1	Q08873	200 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	YPR027C	Q12079	277 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	TY1A-DR4	O74302	440 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	ARG81	P05085	880 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	TY1A-H	P0C2I4	478 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	TY1A-A	P0CX57	440 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	TY1A-PR1	P0CX58	440 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	TY1A-OR	P0CX59	440 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	TY1A-PR2	P0CX60	440 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	TY1A-DR5	P0CX65	440 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	TY1A-ER2	P0CX66	440 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	TY1A-GR3	P0CX67	440 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	TY1A-LR1	P0CX68	440 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	TY1A-MR2	P0CX69	440 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	TY1A-PL	P0CX73	440 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		3.57	□□□□□ -1.84

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