RNA–Protein interactions for RNA: YOL054W

PSH1, Transcript of E3 ubiquitin ligase targeting centromere-binding protein Cse4p, yeast

Gene PSH1, Length 1,221 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PSH1	YOL054W	HEM14	P40012	539 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	RTT105	P40063	208 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	SWC4	P53201	476 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	ERV29	P53337	310 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	ZRG17	P53735	605 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	DML1	Q03652	475 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	BUR2	Q05949	395 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	TPO3	Q06451	622 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	PER33	Q12144	273 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	SIR2	P06700	562 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	STE12	P13574	688 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	AHC2	P25649	128 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	SNC1	P31109	117 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	MKK1	P32490	508 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	MSN2	P33748	704 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	MRPL3	P36516	390 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	YBR137W	P38276	179 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	BIG1	P38813	335 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	ECM27	P47144	725 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	MNT4	P53745	580 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	MSS11	Q03825	758 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	PLM2	Q04383	521 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	ELP6	Q04868	273 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	MRPL35	Q06678	367 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	ATP16	Q12165	160 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	MTR10	Q99189	972 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	QCR7	P00128	127 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	YSR3	P23501	404 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	YCR102C	P25608	368 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	CPR3	P25719	182 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	RNP1	P32385	249 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	KRE6	P32486	720 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	PXA2	P34230	853 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	KKQ8	P36004	724 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	SHE1	P38200	338 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	LEU5	P38702	357 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	RRF1	P38771	230 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	HPA3	P39979	161 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	FAU1	P40099	211 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	YJL068C	P40363	299 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	APQ12	P40532	138 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	YFR018C	P43599	363 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	RPE1	P46969	238 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	SDT1	P53078	280 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	INN1	P53901	409 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	YMR130W	Q04223	302 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	YLR031W	Q07978	186 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	PLB3	Q08108	686 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	RKM5	Q12367	367 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	PCL9	Q12477	304 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	HIS3	P06633	220 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	STE7	P06784	515 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	YOL163W	P0CF20	169 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	REV1	P12689	985 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	RED1	P14291	827 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	SNF6	P18888	332 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	PHO80	P20052	293 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	PDR3	P33200	976 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	MNN2	P38069	597 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	CHS7	P38843	316 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	FMC1	P40491	155 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	MET28	P40573	187 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	PRM10	P42946	383 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	NUP57	P48837	541 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	UBC12	P52491	188 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	EMC4	P53073	190 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	YGL117W	P53133	265 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	POP6	P53218	158 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	COS1	P53822	381 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	HXT11	P54862	567 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	PNG1	Q02890	363 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	OST6	Q03723	332 aa		5.17	□□□□□ -1.58

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