RNA–Protein interactions for RNA: YKL208W

CBT1, Transcript of Protein involved in 5' RNA end processing, yeast

Gene CBT1, Length 816 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CBT1	YKL208W	SAL1	D6W196	494 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	EFM1	P38732	585 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	BIG1	P38813	335 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	BNS1	P50084	137 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	VAC7	P53950	1165 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	INP2	Q03824	705 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	PER33	Q12144	273 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	VHT1	P53241	593 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	KTR6	P54070	446 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	OST6	Q03723	332 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	CSM4	Q08955	156 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	YOR029W	Q12243	111 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	LAG2	Q92325	660 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	CFT1	Q06632	1357 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	CPR3	P25719	182 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	PMT2	P31382	759 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	MRPL6	P32904	214 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	MRX3	P38172	270 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	BMT2	P38278	337 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	CHL4	P38907	458 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	PEX22	P39718	180 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	ASG7	P46993	209 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	YGL260W	P53056	76 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	CTR3	Q06686	241 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	NDD1	Q08887	554 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	MSH5	Q12175	901 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	SSK2	P53599	1579 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	TAF2	P23255	1407 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	REV1	P12689	985 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	SPS100	P13130	326 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	CAB3	P36076	571 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	SOL2	P37262	315 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	YPC1	P38298	316 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	RCK1	P38622	512 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	YML122C	Q03207	126 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	YDR209C	Q03480	137 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	GMC1	Q04399	608 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	TAF9	Q05027	157 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	VIK1	Q12045	647 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	PPA2	P28239	310 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBT1	YKL208W	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CBT1	YKL208W	YKL187C	P34231	750 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBT1	YKL208W	SDS24	P38314	527 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBT1	YKL208W	OXA1	P39952	402 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBT1	YKL208W	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CBT1	YKL208W	NRM1	P53718	249 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBT1	YKL208W	GIM3	P53900	129 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBT1	YKL208W	RNH201	P53942	307 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBT1	YKL208W	YET2	Q04210	160 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBT1	YKL208W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CBT1	YKL208W	SFH1	Q06168	426 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBT1	YKL208W	MCT1	Q12283	360 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBT1	YKL208W	BI3	Q9ZZW7	517 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBT1	YKL208W	ESP1	Q03018	1630 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBT1	YKL208W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CBT1	YKL208W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CBT1	YKL208W	YJR012C	P47087	207 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CBT1	YKL208W	YGR015C	P53208	328 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CBT1	YKL208W	BOR1	P53838	576 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CBT1	YKL208W	BNA7	Q04066	261 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CBT1	YKL208W	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CBT1	YKL208W	YLR177W	Q06251	628 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CBT1	YKL208W	NCB2	Q92317	146 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CBT1	YKL208W	JIP3	O13555	125 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CBT1	YKL208W	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CBT1	YKL208W	CDC50	P25656	391 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CBT1	YKL208W	NAM9	P27929	486 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CBT1	YKL208W	IES6	P32617	166 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CBT1	YKL208W	YPT53	P36019	220 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CBT1	YKL208W	SHE1	P38200	338 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CBT1	YKL208W	LDB7	P38210	180 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CBT1	YKL208W	OM14	P38325	134 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CBT1	YKL208W	SIP3	P38717	1229 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CBT1	YKL208W	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CBT1	YKL208W	YJR054W	P47114	497 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CBT1	YKL208W	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CBT1	YKL208W	DPP1	Q05521	289 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CBT1	YKL208W	PEX30	Q06169	523 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CBT1	YKL208W	SEC10	Q06245	871 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CBT1	YKL208W	ZRC1	P20107	442 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CBT1	YKL208W	POF1	P25576	258 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CBT1	YKL208W	PEX3	P28795	441 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CBT1	YKL208W	AEP1	P32493	518 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CBT1	YKL208W	HEM14	P40012	539 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CBT1	YKL208W	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CBT1	YKL208W	IBA57	P47158	497 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CBT1	YKL208W	SDS23	P53172	527 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CBT1	YKL208W	COG7	P53195	279 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CBT1	YKL208W	CDH1	P53197	566 aa		4.8	□□□□□ -1.64

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