RNA–Protein interactions for RNA: YJL099W

CHS6, Transcript of Member of the ChAPs (Chs5p-Arf1p-binding proteins) family, yeast

Gene CHS6, Length 2,241 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CHS6	YJL099W	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.31
CHS6	YJL099W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	0.59	□□□□□ -2.31
CHS6	YJL099W	DSE1	P40077	573 aa		0.59	□□□□□ -2.31
CHS6	YJL099W	RRG9	P40156	214 aa		0.59	□□□□□ -2.31
CHS6	YJL099W	AIM20	P40451	204 aa		0.59	□□□□□ -2.31
CHS6	YJL099W	NAS2	P40555	220 aa		0.59	□□□□□ -2.31
CHS6	YJL099W	YFL064C	P43540	174 aa		0.59	□□□□□ -2.31
CHS6	YJL099W	COS4	P43542	379 aa		0.59	□□□□□ -2.31
CHS6	YJL099W	GTO1	P48239	356 aa		0.59	□□□□□ -2.31
CHS6	YJL099W	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.31
CHS6	YJL099W	LIF1	P53150	421 aa		0.59	□□□□□ -2.31
CHS6	YJL099W	OKP1	P53298	406 aa		0.59	□□□□□ -2.31
CHS6	YJL099W	YNR066C	P53752	436 aa		0.59	□□□□□ -2.31
CHS6	YJL099W	DIA1	P54005	336 aa		0.59	□□□□□ -2.31
CHS6	YJL099W	YPL077C	Q02831	240 aa		0.59	□□□□□ -2.31
CHS6	YJL099W	RRG8	Q06109	277 aa		0.59	□□□□□ -2.31
CHS6	YJL099W	YLR446W	Q06204	433 aa		0.59	□□□□□ -2.31
CHS6	YJL099W	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.31
CHS6	YJL099W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.31
CHS6	YJL099W	APC9	Q12107	265 aa		0.59	□□□□□ -2.31
CHS6	YJL099W	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.31
CHS6	YJL099W	YDL211C	Q12121	372 aa		0.59	□□□□□ -2.31
CHS6	YJL099W	ERP3	Q12403	225 aa		0.59	□□□□□ -2.31
CHS6	YJL099W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	0.59	□□□□□ -2.31
CHS6	YJL099W	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	0.59	□□□□□ -2.31
CHS6	YJL099W	YPR064W	Q12492	139 aa		0.59	□□□□□ -2.31
CHS6	YJL099W	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	DAL80	P26343	269 aa		0.58	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	0.58	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	IMP1	P28627	190 aa		0.58	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	YKL063C	P35725	167 aa		0.58	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	TPO5	P36029	618 aa		0.58	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	MCH2	P36032	473 aa		0.58	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	MRPL3	P36516	390 aa		0.58	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	YHI9	P38765	294 aa		0.58	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	FET3	P38993	636 aa		0.58	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	ECO1	P43605	281 aa		0.58	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	CPR7	P47103	393 aa		0.58	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	TPC1	P53257	314 aa		0.58	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	0.58	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	YMR209C	Q03648	457 aa		0.58	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	NNT1	Q05874	261 aa		0.58	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	REX3	Q12090	404 aa		0.58	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	YPL150W	Q12152	901 aa		0.58	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	MRX4	Q12467	430 aa		0.58	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		0.58	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	YOL163W	P0CF20	169 aa		0.58	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	RRT12	P25381	491 aa		0.58	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	CSM1	P25651	190 aa		0.58	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	TKL2	P33315	681 aa		0.58	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	RPC37	P36121	282 aa		0.58	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	YKR032W	P36127	104 aa		0.58	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	PHO89	P38361	574 aa		0.58	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	PEX18	P38855	283 aa		0.58	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	AVT6	P40074	448 aa		0.58	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	OSW5	P40219	148 aa		0.58	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	YIL012W	P40551	113 aa		0.58	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	0.58	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	RPE1	P46969	238 aa		0.58	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	MRX5	P47007	382 aa		0.58	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	0.58	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	UBC13	P52490	153 aa		0.58	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	YNL260C	P53846	198 aa		0.58	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	YPL113C	Q02961	396 aa		0.58	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	YMR244W	Q04018	355 aa		0.58	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	TAF9	Q05027	157 aa		0.58	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	STE23	Q06010	1027 aa		0.58	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	ECM19	Q06011	112 aa		0.58	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	VAC14	Q06708	880 aa		0.58	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	ASR1	Q06834	288 aa		0.58	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	YLL007C	Q07799	665 aa		0.58	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	YOR292C	Q08743	309 aa		0.58	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	YPL278C	Q08990	100 aa		0.58	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		0.57	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	YAK1	P14680	807 aa		0.57	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	DAL5	P15365	543 aa		0.57	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	PHO80	P20052	293 aa		0.57	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	DAL81	P21657	970 aa		0.57	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	KRE6	P32486	720 aa		0.57	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	SUA5	P32579	426 aa		0.57	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	0.57	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	YKL162C	P36052	402 aa		0.57	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	CAB3	P36076	571 aa		0.57	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	PRY2	P36110	329 aa		0.57	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	MRPL40	P36534	297 aa		0.57	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	HIS2	P38635	335 aa		0.57	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	YHL044W	P38727	235 aa		0.57	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	SPT8	P38915	602 aa		0.57	□□□□□ -2.32
CHS6	YJL099W	SPO73	P40031	143 aa		0.57	□□□□□ -2.32

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