RNA–Protein interactions for RNA: YHR063C

PAN5, Transcript of 2-dehydropantoate 2-reductase, yeastyeast

Gene PAN5, Length 1,140 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PAN5YHR063C KDX1P36005 433 aa3.29□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C GDT1P38301 280 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C YHL049CP38722 271 aa3.29□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C LCP5P40079 357 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C OSW5P40219 148 aa3.29□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C YFL064CP43540 174 aa3.29□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C SNZ3P43545 298 aa3.29□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C VHT1P53241 593 aa3.29□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C SNZ2P53824 298 aa3.29□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C VAC7P53950 1165 aa3.29□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C PRP38Q00723 242 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C RPL6AQ02326 176 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C YPQ1Q12010 308 aa3.29□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C RRP36Q12481 300 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C TFB5Q3E7C1 72 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C YPR117WQ06116 2489 aa3.28□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C FAA1P30624 700 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C SRB4P32569 687 aa3.28□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C RIB7P33312 244 aa3.28□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C ECT1P33412 323 aa3.28□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C MRPS9P38120 278 aa3.28□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C SHE3P38272 425 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C SWC5P38326 303 aa3.28□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C RTT105P40063 208 aa3.28□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C YIL054WP40524 105 aa3.28□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C HOP2P53187 214 aa3.28□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C KTR6P54070 446 aa3.28□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C ERV25P54837 211 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C RRB1Q04225 511 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C KAP95Q06142 861 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C YLR177WQ06251 628 aa3.28□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C RTC5Q12108 567 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C MDY2Q12285 212 aa3.28□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C SFM1Q12314 213 aa3.28□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C HMS1Q12398 434 aa3.28□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C HEM4P06174 275 aa3.27□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C SCH9P11792 824 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C RPL16AP26784 199 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C GCG1P32656 232 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C MMS21P38632 267 aa3.27□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C END3P39013 349 aa3.27□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C LYS12P40495 371 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C YNL320WP42840 284 aa3.27□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C YNL040WP53960 456 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C SPG3Q04398 127 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C ERV41Q04651 352 aa3.27□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C TAF9Q05027 157 aa3.27□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C PEX27Q08580 376 aa3.27□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C IZH4Q99393 312 aa3.27□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C MET16P18408 261 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C DAL80P26343 269 aa3.26□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C MEI4P29467 408 aa3.26□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C MSK1P32048 576 aa3.26□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C VAM7P32912 316 aa3.26□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C PPQ1P32945 549 aa3.26□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C SOL2P37262 315 aa3.26□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C WSC4P38739 605 aa3.26□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C YDR089WP38966 869 aa3.26□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C AQR1P53943 586 aa3.26□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C LAP3Q01532 483 aaKnown RBP RIP-Chip data3.26□□□□□ -1.89not detected
PAN5YHR063C YMR010WQ03687 405 aa3.26□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C TAF10Q12030 206 aa3.26□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C YDL109CQ12103 647 aa3.26□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C ATP16Q12165 160 aa3.26□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C YDR018CQ12185 396 aa3.26□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C RPL23AP0CX41 137 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C RPL23BP0CX42 137 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C TAL1P15019 335 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C CBF1P17106 351 aa3.25□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C DBP3P20447 523 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C DBR1P24309 405 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C PEX34P25584 144 aa3.25□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C SSE1P32589 693 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C ECM13P38195 257 aa3.25□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C YMR134WP40207 237 aa3.25□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C MOB1P40484 314 aa3.25□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C MIC19P43594 170 aa3.25□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C RPC17P47076 161 aa3.25□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C EFM3P47163 339 aa3.25□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C PEX31P53203 462 aa3.25□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C MAL13P53338 473 aa3.25□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C YNL143CP53908 130 aa3.25□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C RPL21AQ02753 160 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C ECM11Q04110 302 aa3.25□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C FSH2Q05015 223 aa3.25□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C PIN3Q06449 215 aa3.25□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C YOR376WQ08900 122 aa3.25□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C OCA6Q12454 224 aa3.25□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C RPL21BQ12672 160 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C DET1Q99288 334 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C RPS16AP0CX51 143 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C RPS16BP0CX52 143 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C RPO26P20435 155 aa3.24□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C UBA1P22515 1024 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C LDS1P31379 325 aa3.24□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C TPS2P31688 896 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C ZUO1P32527 433 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C PDC2P32896 925 aa3.24□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C BMT2P38278 337 aa3.24□□□□□ -1.89
PAN5YHR063C URA8P38627 578 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.4 ms