RNA–Protein interactions for RNA: YER148W

SPT15, Transcript of TATA-binding protein, yeastyeast

Gene SPT15, Length 723 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT15YER148W COS9P36034 407 aa3.04□□□□□ -1.92
SPT15YER148W ATG7P38862 630 aa3.04□□□□□ -1.92
SPT15YER148W CHL4P38907 458 aa3.04□□□□□ -1.92
SPT15YER148W AIM23P47015 356 aa3.04□□□□□ -1.92
SPT15YER148W YGR015CP53208 328 aa3.04□□□□□ -1.92
SPT15YER148W TRM82Q03774 444 aa3.04□□□□□ -1.92
SPT15YER148W NAT4Q04751 285 aa3.04□□□□□ -1.92
SPT15YER148W YDL144CQ07589 356 aa3.04□□□□□ -1.92
SPT15YER148W APC5Q08683 685 aa3.04□□□□□ -1.92
SPT15YER148W GLE1Q12315 538 aa3.04□□□□□ -1.92
SPT15YER148W TPI1P00942 248 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
SPT15YER148W ERG9P29704 444 aa3.03□□□□□ -1.92
SPT15YER148W RCK2P38623 610 aa3.03□□□□□ -1.92
SPT15YER148W NAS2P40555 220 aa3.03□□□□□ -1.92
SPT15YER148W YJR054WP47114 497 aa3.03□□□□□ -1.92
SPT15YER148W RNH201P53942 307 aa3.03□□□□□ -1.92
SPT15YER148W ALG11P53954 548 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
SPT15YER148W SLT2Q00772 484 aa3.03□□□□□ -1.92
SPT15YER148W RPL21AQ02753 160 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
SPT15YER148W ECM11Q04110 302 aa3.03□□□□□ -1.92
SPT15YER148W CSM3Q04659 317 aa3.03□□□□□ -1.92
SPT15YER148W GAS2Q06135 555 aa3.03□□□□□ -1.92
SPT15YER148W PIN3Q06449 215 aa3.03□□□□□ -1.92
SPT15YER148W MCH1Q07376 486 aa3.03□□□□□ -1.92
SPT15YER148W PML1Q07930 204 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
SPT15YER148W PGC1Q08959 321 aa3.03□□□□□ -1.92
SPT15YER148W FRE8Q12209 686 aa3.03□□□□□ -1.92
SPT15YER148W RPL21BQ12672 160 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
SPT15YER148W PDR18P53756 1333 aa3.02□□□□□ -1.93
SPT15YER148W ASP3-2P0CX77 362 aa3.02□□□□□ -1.93
SPT15YER148W ASP3-3P0CX78 362 aa3.02□□□□□ -1.93
SPT15YER148W ASP3-4P0CX79 362 aa3.02□□□□□ -1.93
SPT15YER148W ASP3-1P0CZ17 362 aa3.02□□□□□ -1.93
SPT15YER148W HXT2P23585 541 aa3.02□□□□□ -1.93
SPT15YER148W BIO3P50277 480 aa3.02□□□□□ -1.93
SPT15YER148W LSG1P53145 640 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
SPT15YER148W YDR115WQ04598 105 aa3.02□□□□□ -1.93
SPT15YER148W YDL012CQ12489 107 aa3.02□□□□□ -1.93
SPT15YER148W RAD1P06777 1100 aa3.01□□□□□ -1.93
SPT15YER148W MSF1P08425 469 aa3.01□□□□□ -1.93
SPT15YER148W UTR1P21373 530 aa3.01□□□□□ -1.93
SPT15YER148W VPS3P23643 1011 aa3.01□□□□□ -1.93
SPT15YER148W DCC1P25559 380 aa3.01□□□□□ -1.93
SPT15YER148W MKK1P32490 508 aa3.01□□□□□ -1.93
SPT15YER148W SMI1P32566 505 aa3.01□□□□□ -1.93
SPT15YER148W YBR241CP38142 488 aa3.01□□□□□ -1.93
SPT15YER148W FIS1P40515 155 aa3.01□□□□□ -1.93
SPT15YER148W ERG10P41338 398 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
SPT15YER148W MOB2P43563 287 aa3.01□□□□□ -1.93
SPT15YER148W CDH1P53197 566 aa3.01□□□□□ -1.93
SPT15YER148W HST1P53685 503 aa3.01□□□□□ -1.93
SPT15YER148W YDR286CQ05530 114 aa3.01□□□□□ -1.93
SPT15YER148W ARR1Q06596 294 aa3.01□□□□□ -1.93
SPT15YER148W YOL024WQ08172 172 aa3.01□□□□□ -1.93
SPT15YER148W RPN8Q08723 338 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
SPT15YER148W YOR376WQ08900 122 aa3.01□□□□□ -1.93
SPT15YER148W PDC2P32896 925 aa3□□□□□ -1.93
SPT15YER148W SKI2P35207 1287 aaKnown RBP RIP-Chip data3□□□□□ -1.93not detected
SPT15YER148W ATG12P38316 186 aa3□□□□□ -1.93
SPT15YER148W ALP1P38971 573 aa3□□□□□ -1.93
SPT15YER148W TIF34P40217 347 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SPT15YER148W YNL320WP42840 284 aa3□□□□□ -1.93
SPT15YER148W YCH1P42937 148 aa3□□□□□ -1.93
SPT15YER148W RMI1Q02685 241 aa3□□□□□ -1.93
SPT15YER148W TAF10Q12030 206 aa3□□□□□ -1.93
SPT15YER148W SRO7Q12038 1033 aa3□□□□□ -1.93
SPT15YER148W YOR097CQ12274 175 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
SPT15YER148W RGS2Q99188 309 aa3□□□□□ -1.93
SPT15YER148W HFA1P32874 2273 aa3□□□□□ -1.93
SPT15YER148W YLL053CP0CD98 152 aa2.99□□□□□ -1.93
SPT15YER148W MRPL40P36534 297 aa2.99□□□□□ -1.93
SPT15YER148W LIN1P38852 340 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
SPT15YER148W PRP39P39682 629 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
SPT15YER148W YFL012WP43580 148 aa2.99□□□□□ -1.93
SPT15YER148W COQ5P49017 307 aa2.99□□□□□ -1.93
SPT15YER148W SHE4P51534 789 aa2.99□□□□□ -1.93
SPT15YER148W FLC3P53121 802 aa2.99□□□□□ -1.93
SPT15YER148W YNL146WP53906 100 aa2.99□□□□□ -1.93
SPT15YER148W MGR3Q04472 501 aa2.99□□□□□ -1.93
SPT15YER148W IES4Q08561 116 aa2.99□□□□□ -1.93
SPT15YER148W RAD3P06839 778 aa2.98□□□□□ -1.93
SPT15YER148W RNR2P09938 399 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
SPT15YER148W EPT1P22140 391 aa2.98□□□□□ -1.93
SPT15YER148W CIN8P27895 1000 aa2.98□□□□□ -1.93
SPT15YER148W SPS19P32573 292 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
SPT15YER148W COT1P32798 439 aa2.98□□□□□ -1.93
SPT15YER148W SMP1P38128 452 aa2.98□□□□□ -1.93
SPT15YER148W MMS21P38632 267 aa2.98□□□□□ -1.93
SPT15YER148W EFM1P38732 585 aa2.98□□□□□ -1.93
SPT15YER148W ATP22P50273 684 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
SPT15YER148W YGL114WP53134 725 aa2.98□□□□□ -1.93
SPT15YER148W SWS2P53937 143 aa2.98□□□□□ -1.93
SPT15YER148W SED5Q01590 340 aa2.98□□□□□ -1.93
SPT15YER148W CWC21Q03375 135 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
SPT15YER148W SCS7Q03529 384 aa2.98□□□□□ -1.93
SPT15YER148W YDR262WQ12331 272 aa2.98□□□□□ -1.93
SPT15YER148W RPN6Q12377 434 aa2.98□□□□□ -1.93
SPT15YER148W RAX2Q12465 1220 aa2.98□□□□□ -1.93
SPT15YER148W YOL085CQ99345 113 aa2.98□□□□□ -1.93
SPT15YER148W RPL4AP10664 362 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
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